RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PLD5Q8N7P1 536 aa18.87■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PCDH19Q8TAB3 1148 aa18.87■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 LPPQ93052 612 aa18.87■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 SEC16BQ96JE7 1060 aa18.87■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.87■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.87■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 GPR182O15218 404 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 BRAFP15056 766 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PNPLA4P41247 253 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 GPX6P59796 221 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 BFSP2Q13515 415 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 BOLA3Q53S33 107 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PCGF5Q86SE9 256 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 LRRC34Q8IZ02 419 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RNF169Q8NCN4 708 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TTC25Q96NG3 672 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CCDC77Q9BR77 488 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CLUHO75153 1309 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 H7C0C1 242 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CLDN5O00501 218 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 HUS1O60921 280 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 ATP5OP48047 213 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 IFT88Q13099 833 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TFDP2Q14188 446 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 ADAM2Q99965 735 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.86■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PIAS1O75925 651 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CLTBP09497 229 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PDK2Q15119 407 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 SLC26A9Q7LBE3 791 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 MAP7D3Q8IWC1 876 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TEKT4Q8WW24 435 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 MAML1Q92585 1016 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TOX2Q96NM4 488 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TBX21Q9UL17 535 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 VGLL3A8MV65 326 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 APOL1O14791 398 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 BEST1O76090 585 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 SSTR1P30872 391 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 MLH1P40692 756 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 WSCD1Q658N2 575 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 C6orf89Q6UWU4 347 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CCDC134Q9H6E4 229 aa18.85■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CYB561D2O14569 222 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 MDM4O15151 490 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PTPN9P43378 593 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RABGGTBP53611 331 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 ARL4CP56559 192 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PIGZQ86VD9 579 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 FUKQ8N0W3 1084 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 CCDC185Q8N715 623 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 GDAP1Q8TB36 358 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 USP29Q9HBJ7 922 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 ALPK3Q96L96 1907 aa18.84■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RASA4BC9J798 803 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PITPNM1O00562 1244 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RASA4O43374 803 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 RBL1P28749 1068 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 LRPAP1P30533 357 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 BCAR1P56945 870 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 SNX16P57768 344 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 SLC9A4Q6AI14 798 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 FBXO36Q8NEA4 188 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 DYDC1Q8WWB3 177 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 TBCBQ99426 244 aa18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
USP18-201ENST00000215794 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms