RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 TATDN2Q93075 761 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 ARID3AQ99856 593 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF4Q9NR80 690 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 SPHK2Q9NRA0 654 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 DNMT3LQ9UJW3 386 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 EML5Q05BV3 1969 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-204ENST00000446285 BICDL2A1A5D9 508 aa28.1■■■□□ 2.09
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ODC1-204ENST00000446285 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.08■■■□□ 2.09
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ODC1-204ENST00000446285 C11orf74Q86VG3 221 aa28.08■■■□□ 2.09
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ODC1-204ENST00000446285 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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ODC1-204ENST00000446285 TBC1D3BA6NDS4 549 aa28.03■■■□□ 2.08
ODC1-204ENST00000446285 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ODC1-204ENST00000446285 RHOBTB1O94844 696 aa28.03■■■□□ 2.08
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