RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 SLC12A1Q13621 1099 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BBS5Q8N3I7 341 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TSPAN1O60635 241 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PDE8AO60658 829 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 VAMP7P51809 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CTSWP56202 376 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MOGQ16653 247 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DDR2Q16832 855 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L12C9JPN9 530 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 USP17L21D6R901 530 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TLR2O60603 784 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RTKNQ9BST9 563 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BARHL2Q9NY43 387 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 XDHP47989 1333 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BTBD19C9JJ37 291 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PDPK1O15530 556 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IL6P05231 212 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PON1P27169 355 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PTK6Q13882 451 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 VTA1Q9NP79 307 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CHKBQ9Y259 395 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 S100A6P06703 90 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RALAP11233 206 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CD58P19256 250 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ARL4AP40617 200 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZBED5Q49AG3 693 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HELQQ8TDG4 1101 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC126Q96EE4 140 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NUAK2Q9H093 628 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CDH22Q9UJ99 828 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.66□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 UBE3AQ05086 875 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CHRNB3Q05901 458 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LPCAT4Q643R3 524 aa6.65□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.65□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MLXQ9UH92 298 aa6.65□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 TAF12Q16514 161 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CCNG2Q16589 344 aa6.65□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SGF29Q96ES7 293 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 USE1Q9NZ43 259 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KRT87PA6NCN2 255 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TOMM70O94826 608 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GRK3P35626 688 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 QPRTQ15274 297 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF677Q86XU0 584 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 STARD8Q92502 1023 aa6.65□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PAK5Q9P286 719 aa6.65□□□□□ -1.34
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