RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 MAN1A1P33908 653 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ALDH3B2P48448 385 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 TNNI2P48788 182 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PPP2R5DQ14738 602 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGEF6Q15052 776 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CCNG2Q16589 344 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 MOGQ16653 247 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 KBTBD6Q86V97 674 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 IP6K1Q92551 441 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SLC35C1Q96A29 364 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 COG8Q96MW5 612 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 GREM2Q9H772 168 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 GCNT3O95395 438 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 BCL10O95999 233 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 NR3C1P04150 777 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CAPN1P07384 714 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CYP2J2P51589 502 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 GAD2Q05329 585 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PTK7Q13308 1070 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SERAC1Q96JX3 654 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 OLFM1Q99784 485 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 VPS45Q9NRW7 570 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PLOD2O00469 737 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 FSCN2O14926 492 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 KMOO15229 486 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 MFN2O95140 757 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SERPINA6P08185 405 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 INHBAP08476 426 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 KCNA6P17658 529 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CD58P19256 250 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ITGAXP20702 1163 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 MAPK4P31152 587 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 IFITM2Q01629 132 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 KCNA1Q09470 495 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ATG16L1Q676U5 607 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 TTC23LQ6PF05 361 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 TDRPQ86YL5 185 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PNMA1Q8ND90 353 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CITED4Q96RK1 184 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 KCNK16Q96T55 309 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CALN1Q9BXU9 219 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 AP4S1Q9Y587 144 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CPQQ9Y646 472 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SQORQ9Y6N5 450 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 H3BNH8 94 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 MEIS1O00470 390 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 DCXO43602 365 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PLA2G4BP0C869 781 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 VDRP11473 427 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 NUDT2P50583 147 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 FAAP100Q0VG06 881 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ZBED5Q49AG3 693 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.834e-6■■■□□ 14.8
TMOD1-203ENST00000395211 LILRA2Q8N149 483 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 HTRA1Q92743 480 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-203ENST00000395211 KLQ9UEF7 1012 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms