RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
DDR2	YOL052C-A	YJR128W	P47162	119 aa		6.31	□□□□□ -1.4
DDR2	YOL052C-A	YHR125W	P38831	101 aa		6.29	□□□□□ -1.4
DDR2	YOL052C-A	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDR2	YOL052C-A	YLR255C	O13574	117 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		6.19	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	COX8	P04039	78 aa		6.18	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	SDH6	Q3E785	79 aa		6.16	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	YJL144W	P47009	104 aa		6.15	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		6.15	□□□□□ -1.42
DDR2	YOL052C-A	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		6.12	□□□□□ -1.43
DDR2	YOL052C-A	YBR016W	P38216	128 aa		6.1	□□□□□ -1.43
DDR2	YOL052C-A	OST5	Q92316	86 aa		6.07	□□□□□ -1.44
DDR2	YOL052C-A	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		6.06	□□□□□ -1.44
DDR2	YOL052C-A	OLI1	P61829	76 aa		6.04	□□□□□ -1.44
DDR2	YOL052C-A	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		6.04	□□□□□ -1.44
DDR2	YOL052C-A	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		6.02	□□□□□ -1.45
DDR2	YOL052C-A	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		6.02	□□□□□ -1.45
DDR2	YOL052C-A	FYV12	Q08559	129 aa		6.01	□□□□□ -1.45
DDR2	YOL052C-A	HUB1	Q6Q546	73 aa		6.01	□□□□□ -1.45
DDR2	YOL052C-A	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		5.99	□□□□□ -1.45
DDR2	YOL052C-A	MRX7	P53869	86 aa		5.96	□□□□□ -1.46
DDR2	YOL052C-A	YGL034C	P53186	121 aa		5.91	□□□□□ -1.46
DDR2	YOL052C-A	YMR122C	Q03879	124 aa		5.84	□□□□□ -1.47
DDR2	YOL052C-A	YJL009W	P47078	108 aa		5.83	□□□□□ -1.48
DDR2	YOL052C-A	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DDR2	YOL052C-A	SBH1	P52870	82 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DDR2	YOL052C-A	YML054C-A	Q3E809	52 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DDR2	YOL052C-A	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DDR2	YOL052C-A	YDR210W	Q03482	75 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DDR2	YOL052C-A	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DDR2	YOL052C-A	YBL044W	P38194	122 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DDR2	YOL052C-A	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		5.58	□□□□□ -1.52
DDR2	YOL052C-A	ATP17	Q06405	101 aa		5.57	□□□□□ -1.52
DDR2	YOL052C-A	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DDR2	YOL052C-A	YCR108C	Q3E819	63 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DDR2	YOL052C-A	YEL014C	P39999	101 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DDR2	YOL052C-A	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
DDR2	YOL052C-A	QCR10	P37299	77 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DDR2	YOL052C-A	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DDR2	YOL052C-A	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DDR2	YOL052C-A	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DDR2	YOL052C-A	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DDR2	YOL052C-A	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DDR2	YOL052C-A	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DDR2	YOL052C-A	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DDR2	YOL052C-A	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDR2	YOL052C-A	SOM1	Q05676	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDR2	YOL052C-A	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDR2	YOL052C-A	HHY1	P39982	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DDR2	YOL052C-A	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DDR2	YOL052C-A	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DDR2	YOL052C-A	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DDR2	YOL052C-A	YHR050W-A	Q05451	56 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DDR2	YOL052C-A	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DDR2	YOL052C-A	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DDR2	YOL052C-A	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.03	□□□□□ -1.76
DDR2	YOL052C-A	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DDR2	YOL052C-A	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	YOL052C-A	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		3.21	□□□□□ -1.9

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