RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C YOR316C-AQ3E806 69 aa0.66□□□□□ -2.3
RPB11YOL005C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YHR073W-AP0C5N7 58 aa0.64□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C INO4P13902 151 aa0.64□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YGR039WP53225 103 aa0.64□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YDR210WQ03482 75 aa0.64□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YLR285C-AQ3E771 56 aa0.64□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C Q0017Q9ZZX8 53 aa0.64□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YCR085WP25650 117 aa0.63□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YBL044WP38194 122 aa0.63□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C ATX1P38636 73 aa0.63□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YCR050CP25630 102 aa0.62□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YGR164WP53291 111 aa0.62□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa0.62□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa0.61□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YBR016WP38216 128 aa0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YEL014CP39999 101 aa0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C RPS29AP41057 56 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C OLI1P61829 76 aa0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YFL041W-AQ3E817 63 aa0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YGR146C-AQ8TGT9 53 aa0.6□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YSY6P38374 65 aa0.59□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YML054C-AQ3E809 52 aa0.59□□□□□ -2.31
RPB11YOL005C YLR255CO13574 117 aa0.58□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C YOR314WQ12506 109 aa0.58□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa0.58□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C SLO1Q3E784 85 aa0.58□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C OST5Q92316 86 aa0.57□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C MRX7P53869 86 aa0.56□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C SDH6Q3E785 79 aa0.56□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa0.56□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C HUB1Q6Q546 73 aa0.55□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa0.55□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C RUB1Q03919 77 aa0.54□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C YDR246W-AQ3E763 66 aa0.54□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa0.54□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C YDR119W-AQ2V2P9 66 aa0.53□□□□□ -2.32
RPB11YOL005C ATP17Q06405 101 aa0.52□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa0.52□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C HHY1P39982 102 aa0.51□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C YDR182W-AQ3E796 67 aa0.51□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C YCR108CQ3E819 63 aa0.51□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C TOM6P33448 61 aa0.48□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C YMR122CQ03879 124 aa0.48□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C YOR072W-BQ3E832 53 aa0.48□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C YCR095W-AQ3E787 52 aa0.47□□□□□ -2.33
RPB11YOL005C YGL014C-AP0C5N1 53 aa0.42□□□□□ -2.34
RPB11YOL005C QCR10P37299 77 aa0.4□□□□□ -2.35
RPB11YOL005C SOM1Q05676 74 aa0.4□□□□□ -2.35
RPB11YOL005C YHR050W-AQ05451 56 aa0.39□□□□□ -2.35
RPB11YOL005C YIR021W-AQ3E739 70 aa0.38□□□□□ -2.35
RPB11YOL005C YBR072C-AQ3E794 53 aa0.36□□□□□ -2.35
RPB11YOL005C YLR157W-EP0CF00 54 aa0.35□□□□□ -2.35
RPB11YOL005C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa0.34□□□□□ -2.36
RPB11YOL005C YOR376W-AQ3E805 51 aa0.33□□□□□ -2.36
RPB11YOL005C YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 116.8 ms