RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W ATP17Q06405 101 aa2.54□□□□□ -2
HCA4YJL033W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
HCA4YJL033W YAR064WP39563 99 aa2.53□□□□□ -2
HCA4YJL033W SOM1Q05676 74 aa2.53□□□□□ -2
HCA4YJL033W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W SNA2P56508 79 aa2.52□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa2.52□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W RPC10P40422 70 aa2.51□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W YLR307C-AQ3E825 87 aa2.51□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W Q0032Q9ZZX7 96 aa2.51□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W YHR007C-AQ07074 71 aa2.5□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W FYV12Q08559 129 aa2.5□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W DDR2P89113 61 aa2.48□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W YGR240C-AQ3E786 66 aa2.48□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W YOR072WQ08486 104 aa2.48□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W DYN1P36022 4092 aa2.47□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W YJL197C-AP0C5P0 93 aa2.47□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W SGF11Q03067 99 aa2.47□□□□□ -2.01
HCA4YJL033W RTC6O14464 93 aa2.46□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W YGL014C-AP0C5N1 53 aa2.46□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa2.46□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W YPR195CQ06594 109 aa2.45□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa2.45□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa2.41□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W YJR128WP47162 119 aa2.4□□□□□ -2.02
HCA4YJL033W YBL008W-AQ3E821 79 aa2.39□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YLR255CO13574 117 aa2.37□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YGL041C-BQ3E750 60 aa2.37□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa2.37□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YDR210WQ03482 75 aa2.35□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W COX8P04039 78 aa2.35□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YDR034C-AP0C289 58 aa2.34□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YEL014CP39999 101 aa2.34□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa2.34□□□□□ -2.03
HCA4YJL033W YOR316C-AQ3E806 69 aa2.31□□□□□ -2.04
HCA4YJL033W CMC4Q3E7A9 73 aa2.31□□□□□ -2.04
HCA4YJL033W OLI1P61829 76 aa2.3□□□□□ -2.04
HCA4YJL033W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
HCA4YJL033W YCR108CQ3E819 63 aa2.29□□□□□ -2.04
HCA4YJL033W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa2.29□□□□□ -2.04
HCA4YJL033W YHR073W-AP0C5N7 58 aa2.29□□□□□ -2.04
HCA4YJL033W YBL044WP38194 122 aa2.27□□□□□ -2.05
HCA4YJL033W YBR016WP38216 128 aa2.26□□□□□ -2.05
HCA4YJL033W YJL144WP47009 104 aa2.26□□□□□ -2.05
HCA4YJL033W COX7P10174 60 aa2.2□□□□□ -2.06
HCA4YJL033W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
HCA4YJL033W LCL1Q02786 101 aa2.17□□□□□ -2.06
HCA4YJL033W YHR032W-AP0C5N6 59 aa2.16□□□□□ -2.06
HCA4YJL033W HHY1P39982 102 aa2.08□□□□□ -2.08
HCA4YJL033W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
HCA4YJL033W YBR072C-AQ3E794 53 aa2.06□□□□□ -2.08
HCA4YJL033W YOR072W-BQ3E832 53 aa2.03□□□□□ -2.08
HCA4YJL033W YJL009WP47078 108 aa2.02□□□□□ -2.09
HCA4YJL033W YML054C-AQ3E809 52 aa1.87□□□□□ -2.11
HCA4YJL033W YHR086W-AQ3E746 53 aa1.83□□□□□ -2.12
HCA4YJL033W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa1.8□□□□□ -2.12
HCA4YJL033W Q0017Q9ZZX8 53 aa1.8□□□□□ -2.12
HCA4YJL033W YHR050W-AQ05451 56 aa1.58□□□□□ -2.16
HCA4YJL033W YLR157W-EP0CF00 54 aa1.52□□□□□ -2.17
HCA4YJL033W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HCA4YJL033W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
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