RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	YDR010C	Q12426	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GGA2	YHR108W	YJR128W	P47162	119 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GGA2	YHR108W	SBH1	P52870	82 aa		5	□□□□□ -1.61
GGA2	YHR108W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGA2	YHR108W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GGA2	YHR108W	HUB1	Q6Q546	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	YGR164W	P53291	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	YLR255C	O13574	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	COX8	P04039	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	OST5	Q92316	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GGA2	YHR108W	YMR122C	Q03879	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GGA2	YHR108W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GGA2	YHR108W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2	YHR108W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2	YHR108W	OLI1	P61829	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	YJL144W	P47009	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	YBR016W	P38216	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GGA2	YHR108W	MRX7	P53869	86 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GGA2	YHR108W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GGA2	YHR108W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GGA2	YHR108W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GGA2	YHR108W	ATP17	Q06405	101 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GGA2	YHR108W	FYV12	Q08559	129 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GGA2	YHR108W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGA2	YHR108W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GGA2	YHR108W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GGA2	YHR108W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GGA2	YHR108W	YGL034C	P53186	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GGA2	YHR108W	YJL009W	P47078	108 aa		4.46	□□□□□ -1.7
GGA2	YHR108W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		4.46	□□□□□ -1.7
GGA2	YHR108W	YBL044W	P38194	122 aa		4.45	□□□□□ -1.7
GGA2	YHR108W	YEL014C	P39999	101 aa		4.43	□□□□□ -1.7
GGA2	YHR108W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		4.41	□□□□□ -1.7
GGA2	YHR108W	YCR108C	Q3E819	63 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GGA2	YHR108W	QCR10	P37299	77 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GGA2	YHR108W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.32	□□□□□ -1.72
GGA2	YHR108W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		4.3	□□□□□ -1.72
GGA2	YHR108W	YDR210W	Q03482	75 aa		4.28	□□□□□ -1.72
GGA2	YHR108W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.28	□□□□□ -1.72
GGA2	YHR108W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GGA2	YHR108W	SOM1	Q05676	74 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GGA2	YHR108W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GGA2	YHR108W	HHY1	P39982	102 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GGA2	YHR108W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		3.93	□□□□□ -1.78
GGA2	YHR108W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
GGA2	YHR108W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
GGA2	YHR108W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GGA2	YHR108W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GGA2	YHR108W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.15	□□□□□ -1.9
GGA2	YHR108W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GGA2	YHR108W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GGA2	YHR108W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GGA2	YHR108W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.66	□□□□□ -1.98
GGA2	YHR108W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.02	□□□□□ -2.09

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