RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YLR157W-DP0CE99 70 aa3.46□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YPR153WQ06537 140 aa3.46□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W HUB1Q6Q546 73 aa3.45□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W MMS2P53152 137 aa3.44□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa3.44□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YDR034C-AP0C289 58 aa3.43□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YBR027CP38220 110 aa3.43□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YJL144WP47009 104 aa3.43□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W TOR1P35169 2470 aa3.43□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W NUM1Q00402 2748 aa3.43□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.42□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W SPG1P50088 95 aa3.4□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa3.4□□□□□ -1.86
VHS1YDR247W YCR095W-AQ3E787 52 aa3.39□□□□□ -1.87
VHS1YDR247W DYN1P36022 4092 aa3.38□□□□□ -1.87
VHS1YDR247W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa3.38□□□□□ -1.87
VHS1YDR247W CUP1-1P0CX80 61 aa3.37□□□□□ -1.87
VHS1YDR247W CUP1-2P0CX81 61 aa3.37□□□□□ -1.87
VHS1YDR247W YJR128WP47162 119 aa3.35□□□□□ -1.87
VHS1YDR247W LCL2Q08045 131 aa3.34□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YOR376W-AQ3E805 51 aa3.33□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa3.32□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YHR073W-AP0C5N7 58 aa3.31□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W ATP17Q06405 101 aa3.3□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa3.3□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YLR255CO13574 117 aa3.29□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YML100W-AQ8TGT0 57 aa3.29□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W LCL1Q02786 101 aa3.28□□□□□ -1.88
VHS1YDR247W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa3.27□□□□□ -1.89
VHS1YDR247W YOR316C-AQ3E806 69 aa3.27□□□□□ -1.89
VHS1YDR247W COX8P04039 78 aa3.25□□□□□ -1.89
VHS1YDR247W YGL149WP53116 101 aa3.25□□□□□ -1.89
VHS1YDR247W DDR48P18899 430 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VHS1YDR247W MRX7P53869 86 aa3.19□□□□□ -1.9
VHS1YDR247W OLI1P61829 76 aa3.19□□□□□ -1.9
VHS1YDR247W FYV12Q08559 129 aa3.19□□□□□ -1.9
VHS1YDR247W YBR016WP38216 128 aa3.18□□□□□ -1.9
VHS1YDR247W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
VHS1YDR247W COX7P10174 60 aa3.14□□□□□ -1.91
VHS1YDR247W YGL014C-AP0C5N1 53 aa3.11□□□□□ -1.91
VHS1YDR247W QCR10P37299 77 aa3.11□□□□□ -1.91
VHS1YDR247W YEL014CP39999 101 aa3.09□□□□□ -1.92
VHS1YDR247W YHR086W-AQ3E746 53 aa3.05□□□□□ -1.92
VHS1YDR247W YCR108CQ3E819 63 aa3.03□□□□□ -1.92
VHS1YDR247W YBL044WP38194 122 aa3.01□□□□□ -1.93
VHS1YDR247W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa3□□□□□ -1.93
VHS1YDR247W SOM1Q05676 74 aa2.97□□□□□ -1.93
VHS1YDR247W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
VHS1YDR247W YDR210WQ03482 75 aa2.86□□□□□ -1.95
VHS1YDR247W CMC4Q3E7A9 73 aa2.83□□□□□ -1.96
VHS1YDR247W YJL009WP47078 108 aa2.8□□□□□ -1.96
VHS1YDR247W Q0017Q9ZZX8 53 aa2.79□□□□□ -1.96
VHS1YDR247W YML054C-AQ3E809 52 aa2.78□□□□□ -1.96
VHS1YDR247W YOR072W-BQ3E832 53 aa2.77□□□□□ -1.97
VHS1YDR247W HHY1P39982 102 aa2.74□□□□□ -1.97
VHS1YDR247W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
VHS1YDR247W YBR072C-AQ3E794 53 aa2.72□□□□□ -1.97
VHS1YDR247W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa2.24□□□□□ -2.05
VHS1YDR247W YHR050W-AQ05451 56 aa2.21□□□□□ -2.06
VHS1YDR247W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
VHS1YDR247W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
VHS1YDR247W YLR157W-EP0CF00 54 aa1.91□□□□□ -2.1
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