RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 CXCL8P10145 99 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 EPHB2P29323 1055 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 STK40Q8N2I9 435 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 COPS5Q92905 334 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM237Q96Q45 408 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PANX3Q96QZ0 392 aa6.53□□□□□ -1.36
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SMAD4-212ENST00000591126 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 URADA6NGE7 173 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MEIS2O14770 477 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 FOXN1O15353 648 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ATP9BO43861 1147 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PPFIA2O75334 1257 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 GUCY1B2O75343 617 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MED24O75448 989 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 CLDN11O75508 207 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 GLP2RO95838 553 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 IQCF3P0C7M6 154 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 GLRA2P23416 452 aa6.52□□□□□ -1.36
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SMAD4-212ENST00000591126 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MIB1Q86YT6 1006 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 BBS2Q9BXC9 721 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 STOML1Q9UBI4 398 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.52□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ENC1O14682 589 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 B4GALT4O60513 344 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SLC4A1P02730 911 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LTFP02788 710 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NPR3P17342 541 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NOS2P35228 1153 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGAP1Q07960 439 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 STRADBQ9C0K7 418 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MAGEB16A2A368 324 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 HEATR9A2RTY3 570 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 HACD1B0YJ81 288 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF217O75362 1048 aa6.52□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 ACRP10323 421 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KCNA2P16389 499 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 STX2P32856 288 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NR2C2P49116 596 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MAP3K7CLP57077 242 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 IRX4P78413 519 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ACOT1Q86TX2 421 aa6.52□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 FBF1Q8TES7 1133 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TRIB2Q92519 343 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 RIT1Q92963 219 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TEPSINQ96N21 525 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 EGFL8Q99944 293 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GRIN2DO15399 1336 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 DYNC1I1O14576 645 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SLC37A4O43826 429 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MSH3P20585 1137 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 AKAP5P24588 427 aa6.52□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 NCKAP1LP55160 1127 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MCL1Q07820 350 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GRB10Q13322 594 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 KRT31Q15323 416 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 JADE1Q6IE81 842 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 RGS18Q9NS28 235 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 AHSPQ9NZD4 102 aa6.52□□□□□ -1.37
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