RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 CFAP99D6REC4 459 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 AP1G2O75843 785 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 USP17L8P0C7I0 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRR14Q9BWN1 585 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 COG6Q9Y2V7 657 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP4CP60510 307 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 STAC3Q96MF2 364 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 C6orf229H3BNL8 230 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEGQ6S5H5 508 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 WBP1LQ9NX94 342 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRAK2O60296 914 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPR37L1O60883 481 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 RETREG3Q86VR2 466 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEMA6NI47 508 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 Q3C1V9 767 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRR7Q8TB68 274 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 THAP11Q96EK4 314 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 BRICD5Q6PL45 260 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 RAD21O60216 631 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 DESI1Q6ICB0 168 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARID3CA6NKF2 412 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 APBB1O00213 710 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 NR1I2O75469 434 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 TSC1Q92574 1164 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 IRF5Q13568 498 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 MSS51Q4VC12 460 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 LYPD8Q6UX82 237 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 JUNDP17535 347 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 ABL2P42684 1182 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 TLL1O43897 1013 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 COPS2P61201 443 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARXQ96QS3 562 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 MTRQ99707 1265 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 NR6A1Q15406 480 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 PTPRNQ16849 979 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPSB2Q99619 263 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU6-677P-201ENST00000516914 POM121CA8CG34 1229 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZPR1O75312 459 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADH1BP00325 375 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 MMP16P51512 607 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 PTPN5P54829 565 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 WWC1Q8IX03 1113 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF516Q92618 1163 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 IL21Q9HBE4 155 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP10Q9P2G4 905 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 WASHC4Q2M389 1173 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 GLMNQ92990 594 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARID3AQ99856 593 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 VAC14Q08AM6 782 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 HOMEZQ8IX15 550 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-677P-201ENST00000516914 KCNH2Q12809 1159 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms