RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000090006.11

Itgb1-201, Transcript of Integrin beta-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Itgb1, Length 3,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pde9aO70628 534 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Proser1Q5PRE5 913 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Fam185aQ7TPD2 378 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Alkbh8Q80Y20 664 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 StgQ8BM15 349 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Med15Q924H2 789 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tgm5Q9D7I9 724 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 PgdQ9DCD0 483 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Krt83E9Q1Y9 479 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 H2-M9O19442 342 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Mmp15O54732 657 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pole2O54956 527 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Grem2O88273 168 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 AmhP27106 555 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Rmdn3Q3UJU9 470 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Sfr1Q8BP27 319 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Azin2Q8BVM4 459 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Rtp1Q8C8C1 263 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Onecut3Q8K557 490 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gtf2a1lQ8R4I4 468 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pcdhga4Q91XY4 930 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Rnf31Q924T7 1066 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Anxa9Q9JHQ0 345 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tsga8Q9JJL0 238 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Kcnq2Q9Z351 759 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Sult2a6B2RVI8 285 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Herc6F2Z461 1003 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 F830016B08RikG3UWE2 416 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Aff2O55112 1272 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Lypla1P97823 230 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Krt80Q0VBK2 452 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Grm6Q5NCH9 871 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Dsg1aQ61495 1057 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Dpysl3Q62188 570 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Bmt2Q8BXK4 403 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Adprhl2Q8CG72 370 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Cog2Q921L5 731 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 PolhQ9JJN0 694 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Copg2Q9QXK3 871 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Akap1O08715 857 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Magea5O89009 320 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Magea8O89012 320 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Epb41P48193 858 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Taf1bP97358 586 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ttc39dQ0VF76 604 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Olfml2bQ3V1G4 746 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Hsfy2Q80Y37 392 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Lsm14aQ8K2F8 462 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pole4Q9CQ36 118 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Chit1Q9D7Q1 464 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Znf354bQ9QXT9 601 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gpc6Q9R087 555 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ap4s1Q9WVL1 144 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gm3752A6NAT4 150 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Grip2G3XA20 1042 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Mt-CybP00158 381 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Krt10P02535 570 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Crhr1P35347 415 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Psmc5P62196 406 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Spink5Q148R4 1017 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Coq10bQ3THF9 240 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ccdc51Q3URS9 406 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Rbm44Q3V089 1013 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Slc44a2Q8BY89 706 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Kcnv2Q8CFS6 562 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Irak3Q8K4B2 609 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Spesp1Q9D5A0 399 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tspan17Q9D7W4 270 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 ParvaQ9EPC1 372 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tuba8Q9JJZ2 449 aa14.89□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 EloblA6PWE0 161 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Klf1P46099 358 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gad2P48320 585 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 CstaP56567 97 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Rhbdl3P58873 404 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 rp9P97762 213 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Akap4Q60662 849 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Epb41l5Q8BGS1 731 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Snapc1Q8K0S9 389 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gm3404Q9D506 307 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Klhl4B1AZR0 717 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Siah3B2RWG3 268 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Exoc7O35250 697 aa14.88□□□□□ -0.03
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ppargc1aO70343 797 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43 ms