RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	YIR020C	P40575	100 aa		3.15	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YPR153W	Q06537	140 aa		3.15	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YDL157C	Q12082	118 aa		3.15	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	OST5	Q92316	86 aa		3.15	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	DYN1	P36022	4092 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YBR209W	P38311	105 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	SNN1	P48232	102 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YNR077C	P53758	84 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	RSM18	P40033	138 aa		3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	DCV1	P43595	202 aa		3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YGL149W	P53116	101 aa		3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	BRP1	P53194	125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YDR114C	Q04597	100 aa		3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		3.13	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	RRT15	Q3E811	62 aa		3.12	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.12	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		3.12	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	AGA2	P32781	87 aa		3.11	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YPI1	P43587	155 aa		3.11	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
KTR2	YKR061W	ATX1	P38636	73 aa		3.1	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	PCC1	Q3E833	88 aa		3.1	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	PAU19	P0CE85	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	PAU3	P25610	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	DAD4	P69851	72 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	ICY1	Q04329	127 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	AVO2	Q04749	426 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	YPR195C	Q06594	109 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	PAU23	Q07987	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	PAU17	Q12370	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KTR2	YKR061W	CCW14	O13547	238 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	RTC6	O14464	93 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YHR022C	P38763	256 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	RGM1	Q00453	211 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	SEC11	P15367	167 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	PAU16	P35994	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	PAU15	P40585	124 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	COX8	P04039	78 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	RPB7	P34087	171 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	ICS3	P47034	131 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	HPA2	Q06592	156 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	MRP17	P28778	131 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	UTR5	P32630	166 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YEL014C	P39999	101 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	MIC27	P50945	234 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	IMP2	P46972	177 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YBR292C	P38357	123 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	MIX17	Q03667	156 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	YLR194C	Q05777	254 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KTR2	YKR061W	COX23	P38824	151 aa		3.02	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		3.02	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	QCR8	P08525	94 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	ROX3	P25046	220 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	KRE9	P39005	276 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	MRPS9	P38120	278 aa		3	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	PAU5	P43575	122 aa		3	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3	□□□□□ -1.93	not detected
KTR2	YKR061W	CYT2	Q00873	224 aa		3	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	FIT2	Q08906	153 aa		3	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		3	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	PFY1	P07274	126 aa		2.99	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YBR027C	P38220	110 aa		2.99	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	POR2	P40478	281 aa		2.99	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YNL198C	P40166	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	COX12	Q01519	83 aa		2.98	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.98	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	YOR105W	Q08504	108 aa		2.98	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
KTR2	YKR061W	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.96	□□□□□ -1.94
KTR2	YKR061W	YJL144W	P47009	104 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.6 ms