RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C YDL241WQ07738 123 aa3.88□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C RPL28P02406 149 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YFR057WP43625 151 aa3.87□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YNL190WP53872 204 aa3.87□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C LCL2Q08045 131 aa3.87□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C IGO2Q9P305 131 aa3.87□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C QCR8P08525 94 aa3.86□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C UGX2P32772 223 aa3.86□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C SMP1P38128 452 aa3.86□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C PAU23Q07987 124 aa3.86□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C PAU17Q12370 124 aa3.86□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YDR034C-AP0C289 58 aa3.85□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C PPT2Q12036 173 aa3.85□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C OXA1P39952 402 aa3.84□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C CWP2P43497 92 aa3.84□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C SAE3P89114 91 aa3.84□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.84□□□□□ -1.79
RRP4YHR069C MBF1O14467 151 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C SNA2P56508 79 aa3.83□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C YDR029WQ12111 104 aa3.83□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C STF1P01098 86 aa3.82□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C HOT13P36078 116 aa3.82□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C YLL006W-AQ3E814 58 aa3.82□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C AQY2P0CD90 149 aa3.81□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C HAP3P13434 144 aa3.81□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C MID2P36027 376 aa3.81□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C PEX22P39718 180 aa3.81□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C MVB12P42939 101 aa3.81□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C IGD1P43598 195 aa3.81□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C YFL019CP43576 117 aa3.79□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C ELC1Q03071 99 aa3.79□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C YLR363W-AQ3E747 85 aa3.79□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
RRP4YHR069C ABF2Q02486 183 aa3.78□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C YML079WQ03629 201 aa3.78□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C HPA2Q06592 156 aa3.78□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C YER175W-AQ8TGU4 54 aa3.78□□□□□ -1.8
RRP4YHR069C YBL039W-BP0C268 59 aa3.77□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C CPR1P14832 162 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C AIM19P40502 157 aa3.77□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C RGM1Q00453 211 aa3.77□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YLR307C-AQ3E825 87 aa3.77□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C ECM12O13529 151 aa3.76□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YIA6P40556 373 aa3.76□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C GLC8P41818 229 aa3.76□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YLR296WQ05898 108 aa3.76□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa3.76□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YGL041C-BQ3E750 60 aa3.75□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YOR020W-AQ3E824 90 aa3.75□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C UBC4P15731 148 aa3.74□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YER181CP40097 107 aa3.74□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C KNH1P50112 268 aa3.74□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C Q0032Q9ZZX7 96 aa3.74□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YGL193CP53097 103 aa3.73□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C IRC21Q04772 201 aa3.73□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C PAI3P01094 68 aa3.72□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YPR170W-BP0C5R9 85 aa3.72□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C COX10P21592 462 aa3.72□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C YHR130CP38834 111 aa3.72□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C LCL1Q02786 101 aa3.72□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C ICY1Q04329 127 aa3.72□□□□□ -1.81
RRP4YHR069C POP7P38291 140 aa3.71□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C EOS1P53938 366 aa3.71□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C CWC27Q02770 301 aa3.71□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C MHR1Q06630 226 aa3.71□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YOR034C-AQ3E735 80 aa3.71□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YIL102C-AQ2V2P5 75 aa3.7□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YNL198CP40166 100 aa3.69□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa3.69□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C MMS2P53152 137 aa3.68□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YBR230W-AQ3E762 66 aa3.68□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YLR236CA0A023PZG4 107 aa3.67□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C MSA2P36157 363 aa3.67□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YPL257WQ08974 193 aa3.67□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa3.67□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C HUR1P45820 110 aa3.66□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YJL127C-BQ3E828 52 aa3.66□□□□□ -1.82
RRP4YHR069C YLR156WP0CE96 114 aa3.65□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C YLR159WP0CE97 114 aa3.65□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C YLR161WP0CE98 114 aa3.65□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C FYV5P25585 152 aa3.65□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C UIP3P39547 235 aa3.65□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C MPC3P53311 146 aa3.64□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C YER039C-AP0CD97 72 aa3.63□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C DDR48P18899 430 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C DDR2P89113 61 aa3.63□□□□□ -1.83
RRP4YHR069C YBL112CQ3E7Y4 105 aa3.63□□□□□ -1.83
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