RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 USP45Q70EL2 814 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM192Q8IY95 271 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TDHQ8IZJ6 230 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ULK4Q96C45 1275 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 CPB2Q96IY4 423 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TEX12Q9BXU0 123 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 DDIT4Q9NX09 232 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SOBPA7XYQ1 873 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 RASGRF2O14827 1237 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SPAG6O75602 509 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 KRT38O76015 456 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MLYCDO95822 493 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MXRA7P84157 204 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TWF1Q12792 350 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PLD4Q96BZ4 506 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 LZTS1Q9Y250 596 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SRGAP2O75044 1071 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 F2P00734 622 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 HMBSP08397 361 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 CYBAP13498 195 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ATP1A3P13637 1013 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 AP2B1P63010 937 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 GCNT1Q02742 428 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 STAT4Q14765 748 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MORN1Q5T089 497 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 EMC10Q5UCC4 262 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 KAZNQ674X7 775 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 WDR41Q9HAD4 459 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.55□□□□□ -1.36
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SMAD4-212ENST00000591126 USP18Q9UMW8 372 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 NEMP2A6NFY4 417 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 GPC4O75487 556 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 NDUFS3O75489 264 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 KRT37O76014 449 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TKTL1P51854 596 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 CDH6P55285 790 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MAP3K10Q02779 954 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 FAF2Q96CS3 445 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ACBD6Q9BR61 282 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ABCB6Q9NP58 842 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 FANCFQ9NPI8 374 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SEPT3Q9UH03 358 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ERICH4A6NGS2 130 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TERF1P54274 439 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MYL6P60660 151 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 RFFLQ8WZ73 363 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 NAT9Q9BTE0 207 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 FANCLQ9NW38 375 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 ABI3Q9P2A4 366 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD4-212ENST00000591126 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.54□□□□□ -1.36
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