RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541696.1

QKI-212, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 2

Gene QKI, Length 1,097 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-212ENST00000541696 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.4□□□□□ -1.22
QKI-212ENST00000541696 NDE1Q9NXR1 346 aa7.4□□□□□ -1.22
QKI-212ENST00000541696 AMACRQ9UHK6 382 aa7.4□□□□□ -1.22
QKI-212ENST00000541696 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.4□□□□□ -1.22
QKI-212ENST00000541696 CROTQ9UKG9 612 aa7.4□□□□□ -1.22
QKI-212ENST00000541696 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
QKI-212ENST00000541696 NCANO14594 1321 aa7.4□□□□□ -1.22
QKI-212ENST00000541696 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TMEM247A6NEH6 219 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 EYA2O00167 538 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 KLRC4O43908 158 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 FKBP6O75344 327 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TCEA3O75764 348 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ANXA1P04083 346 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 IGKV5-2P06315 115 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CRABP2P29373 138 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HOXC9P31274 260 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HOXD12P35452 270 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 UBA7P41226 1012 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SLC18A1P54219 525 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 GIT2Q14161 759 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SPARCL1Q14515 664 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SLC29A2Q14542 456 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 UBE3CQ15386 1083 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZNF174Q15697 407 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 AOC3Q16853 763 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 P3H1Q32P28 736 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 JAMLQ86YT9 394 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 VPS52Q8N1B4 723 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SCAIQ8N9R8 606 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 FNDC8Q8TC99 324 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 MGARPQ8TDB4 240 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 DDI1Q8WTU0 396 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 STAMQ92783 540 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CASP10Q92851 521 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 NINJ1Q92982 152 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 AK8Q96MA6 479 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ECSITQ9BQ95 431 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 STK32BQ9NY57 414 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SENP1Q9P0U3 644 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HAO1Q9UJM8 370 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 DMTF1Q9Y222 760 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.39□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 A0A1W2PQU0 124 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TMPRSS2O15393 492 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HAUS5O94927 633 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 H2AFZP0C0S5 128 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 BRAFP15056 766 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 L1CAMP32004 1257 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PLTPP55058 493 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HDAC4P56524 1084 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ASIC1P78348 528 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CAV1Q03135 178 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CALCOCO2Q13137 446 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 MAPK7Q13164 816 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CDK5R2Q13319 367 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 MED21Q13503 144 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 KYNUQ16719 465 aa7.38□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 INF2Q27J81 1249 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100 ms