RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460981.1

REV3L-208, Transcript of REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit, human

TSL 2

Gene REV3L, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REV3L-208	ENST00000460981	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REV3L-208	ENST00000460981	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	DCLK1	O15075	740 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CCKAR	P32238	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	GALE	Q14376	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	GOLIM4	O00461	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PRC1	O43663	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	RASSF9	O75901	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SOAT2	O75908	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ZBED1	O96006	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	RHCE	P18577	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PLCD1	P51178	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	FAM193A	P78312	1265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SATB1	Q01826	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	RHD	Q02161	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	RAB32	Q13637	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	QSOX1	O00391	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PPM1D	O15297	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MYL3	P08590	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	GNAL	P38405	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ITGA8	P53708	1063 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	LINC00205	P59089	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CNGA2	Q16280	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MYMK	A6NI61	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	TH	P07101	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MYF5	P13349	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CYP2C18	P33260	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PRKAG1	P54619	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	LOXL3	P58215	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	FMO1	Q01740	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SP2	Q02086	613 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MIDN	Q504T8	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REV3L-208	ENST00000460981	SOCS2	O14508	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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