RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPH5Q9H2P9 285 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PITPNM1O00562 1244 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNJ1P48048 391 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF5Q15542 800 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZWILCHQ9H900 591 aa22.93■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRAP2O75791 330 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT10P13645 584 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DESP17661 470 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SDC4P31431 198 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN9P43378 593 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGZQ86VD9 579 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATL2Q8NHH9 583 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED4Q9NPJ6 270 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.92■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM200BP0CF97 657 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDELR1P24390 212 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCY2Q08462 1091 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSC1Q08554 894 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC142Q17RM4 750 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALS2CLQ60I27 953 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEFB118Q96PH6 123 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLDN5O00501 218 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAS8O95995 478 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX1Q13596 522 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL23Q86XA0 190 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 URGCPQ8TCY9 931 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUSD3Q96L08 255 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEBP4Q96S96 227 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACBD6Q9BR61 282 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.91■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBNO60934 754 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENDOD1O94919 500 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCP1P13796 627 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT17Q04695 432 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTK6Q13882 451 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPNMBQ14956 572 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTFR1Q15390 333 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R7Q15435 360 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KAZNQ674X7 775 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM35AQ86V20 835 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC45Q96CN5 670 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCED1BQ96HM7 432 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBCBQ99426 244 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED10Q9BTT4 135 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT82Q9NSB4 513 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX24Q9Y343 169 aa22.9■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIASO43766 372 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRPSAP2O60256 369 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TYMPP19971 482 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRCC3P46736 316 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMNB2Q03252 620 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEKT4Q8WW24 435 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMO2Q99518 471 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.89■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRDP23468 1912 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H3BQF6 201 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms