RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	AGE2	P40529	298 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RTC3	YHR087W	YKL070W	P36087	169 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RTC3	YHR087W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RTC3	YHR087W	CWC27	Q02770	301 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RTC3	YHR087W	YJR146W	P47174	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RTC3	YHR087W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RTC3	YHR087W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	TRP1	P00912	224 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	UIP3	P39547	235 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	YPL073C	P40323	161 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	YPS5	P53057	165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	COX12	Q01519	83 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	YML079W	Q03629	201 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	MLF3	P32047	452 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	YNL217W	P40152	326 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	YPL261C	Q08976	102 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	MRP49	P32388	137 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	PMP3	P87284	55 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	UBC5	P15732	148 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RTC3	YHR087W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	KRE9	P39005	276 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	YKR041W	P36134	250 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	AIM11	P87275	137 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	VAM10	Q08474	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RTC3	YHR087W	ATP15	P21306	62 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YLR281C	Q05863	155 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	AIM29	P36154	155 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	SCW10	Q04951	389 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	IGO2	Q9P305	131 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YEL067C	P39978	195 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YEL008W	P40001	126 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YLR194C	Q05777	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YCR001W	P25347	104 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YBR209W	P38311	105 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YNR077C	P53758	84 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	ELC1	Q03071	99 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	PEX17	P40155	199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RTC3	YHR087W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	11.08	□□□□□ -0.64	not detected
RTC3	YHR087W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YAR029W	P39549	74 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YIL059C	P40520	121 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YLR296W	Q05898	108 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YGL088W	P53151	121 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	SGF11	Q03067	99 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YPT53	P36019	220 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	OXA1	P39952	402 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	NRG2	P38082	220 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	SHU1	P38751	150 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	CIN5	P40917	295 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RTC3	YHR087W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	QCR8	P08525	94 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	CRC1	Q12289	327 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	YLR122C	Q12312	125 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	11	□□□□□ -0.65	not detected
RTC3	YHR087W	MRPS12	P53732	153 aa		11	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	YER181C	P40097	107 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	PAI3	P01094	68 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	YFR057W	P43625	151 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	YER085C	P40058	173 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
RTC3	YHR087W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	UGX2	P32772	223 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	ERG28	P40030	148 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	YMR295C	Q03559	197 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	POP7	P38291	140 aa		10.93	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	YNL198C	P40166	100 aa		10.93	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	PPT2	Q12036	173 aa		10.93	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	YBR219C	P38317	127 aa		10.92	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	ENV10	Q99382	181 aa		10.92	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	COX14	P39103	70 aa		10.91	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	HAL1	Q01766	294 aa		10.91	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		10.9	□□□□□ -0.66
RTC3	YHR087W	ANB1	P19211	157 aa		10.89	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	SPC1	P46965	94 aa		10.88	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	ISU2	Q12056	156 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	AUA1	P32450	94 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	TOA2	P32774	122 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	YNL190W	P53872	204 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RTC3	YHR087W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67

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