RNA–Protein interactions for RNA: YER087W

AIM10, Transcript of Protein with similarity to tRNA synthetases, yeast

Gene AIM10, Length 1,731 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM10	YER087W	CAB4	P53332	305 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	DAD4	P69851	72 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	HAL1	Q01766	294 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	ATP5	P09457	212 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	FZF1	P32805	299 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.61	□□□□□ -1.83	not detected
AIM10	YER087W	PAU7	P39545	55 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	CAX4	P53223	239 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	PAU16	P35994	123 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	TEM1	P38987	245 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	YDR274C	P87283	123 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	UBC7	Q02159	165 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	CNL1	Q06333	122 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	NAT5	Q08689	176 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	YKR041W	P36134	250 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	MPC2	P38857	129 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AIM10	YER087W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	GLE2	P40066	365 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YMR141C	P40211	102 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	ATG39	Q06159	398 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	IMP2	P46972	177 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YGR017W	P53210	297 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
AIM10	YER087W	YNL184C	P53876	108 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	HAP3	P13434	144 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	NRG2	P38082	220 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YER076C	P40049	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	POR2	P40478	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	UPS3	Q04006	179 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	MSA2	P36157	363 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YGR025W	P53216	100 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	ABF2	Q02486	183 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	SNF11	P38956	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	BRP1	P53194	125 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	CWC27	Q02770	301 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	PAU23	Q07987	124 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YDL157C	Q12082	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	PAU17	Q12370	124 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	SEC11	P15367	167 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YGL230C	P53074	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	GPI19	Q04082	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YHR140W	P38842	239 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM10	YER087W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.53	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YCR023C	P25351	611 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	TVP18	Q04767	167 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YKR032W	P36127	104 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YDR366C	P87287	132 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	COX12	Q01519	83 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YML079W	Q03629	201 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	PRM7	Q12459	698 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	SPI1	P40092	148 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YDR042C	Q03205	200 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YMR103C	Q04436	120 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	PFY1	P07274	126 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	HMRA2	P0CY13	119 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	MRP49	P32388	137 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YKL044W	P36092	106 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YHR022C	P38763	256 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	MGR2	Q02889	113 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
AIM10	YER087W	YER135C	P40082	130 aa		3.47	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.1 ms