RNA–Protein interactions for RNA: YER086W

ILV1, Transcript of Threonine deaminase, catalyzes first step in isoleucine biosynthesis, yeast

Gene ILV1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ILV1	YER086W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	SAL1	D6W196	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	TOS6	P48560	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	COX12	Q01519	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	FYV7	Q12247	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	FUN14	P18411	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	YCR023C	P25351	611 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	ABF2	Q02486	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	DPP1	Q05521	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	SCM4	P32564	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ILV1	YER086W	ATP23	P53722	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	DCV1	P43595	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YPS5	P53057	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	MRPL44	P19956	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YKR041W	P36134	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	BET5	Q03630	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	SEC11	P15367	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	OXA1	P39952	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YGL230C	P53074	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YCR007C	P25354	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	KRE9	P39005	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YNL217W	P40152	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	HAC1	P41546	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	VAM10	Q08474	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	APS1	P35181	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YJR146W	P47174	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	DGA1	Q08650	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	ATP5	P09457	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	UBC5	P15732	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	NRG2	P38082	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	MRP49	P32388	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	NAT5	Q08689	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ILV1	YER086W	YCR001W	P25347	104 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	AUA1	P32450	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	TRP1	P00912	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	YKL044W	P36092	106 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	PMP3	P87284	55 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	SGF11	Q03067	99 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	PAU23	Q07987	124 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	PAU17	Q12370	124 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	SAE3	P89114	91 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	SCW10	Q04951	389 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	CRC1	Q12289	327 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	YPT53	P36019	220 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	YEL008W	P40001	126 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.47	□□□□□ -1.69	not detected
ILV1	YER086W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.46	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	AIM11	P87275	137 aa		4.46	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	HAL1	Q01766	294 aa		4.46	□□□□□ -1.69
ILV1	YER086W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YBR209W	P38311	105 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YAR029W	P39549	74 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	ATP15	P21306	62 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YPL073C	P40323	161 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YIL059C	P40520	121 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YGL088W	P53151	121 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.43	□□□□□ -1.7	not detected
ILV1	YER086W	YEL067C	P39978	195 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	GLC8	P41818	229 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YNL184C	P53876	108 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	PEX17	P40155	199 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	SPC1	P46965	94 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ILV1	YER086W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.41	□□□□□ -1.7

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