RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB3	YJL134W	BRP1	P53194	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YGR025W	P53216	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	DIA1	P54005	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	RRG8	Q06109	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	ATG39	Q06159	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	ATP5	P09457	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	UIP3	P39547	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	MST28	P39552	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	MST27	P53176	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	CAX4	P53223	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YIP3	P53633	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	SPI1	P40092	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	SAE3	P89114	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	PRM3	Q08931	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YHR022C	P38763	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	DPP1	Q05521	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	NAT5	Q08689	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	PRM7	Q12459	698 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	CCW14	O13547	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YKR032W	P36127	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	PET8	P38921	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	CCW12	Q12127	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YCR023C	P25351	611 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	AGA1	P32323	725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YER076C	P40049	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	HAC1	P41546	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	KEG1	P43614	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YGL230C	P53074	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	MSC3	Q05812	728 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	SEC11	P15367	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YCR007C	P25354	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YBR144C	P34215	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	GLC8	P41818	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	FIP1	P45976	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YDL186W	P48568	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	TVP18	Q04767	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	APS1	P35181	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YER135C	P40082	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	SIM1	P40472	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	ATP23	P53722	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	MGR2	Q02889	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	SAL1	D6W196	494 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	PFY1	P07274	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	MIG1	P27705	504 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	PAU23	Q07987	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	PAU17	Q12370	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	VAR1	P02381	398 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	CDC43	P18898	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	ALG13	P53178	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	Q0255	P03881	472 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	HAP3	P13434	144 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	MIG3	P39943	394 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	MIC26	P50087	233 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	YDR366C	P87287	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	VPS71	Q03433	280 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB3	YJL134W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	UTR5	P32630	166 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	TOS6	P48560	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	CWC27	Q02770	301 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	MHR1	Q06630	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCB3	YJL134W	YKL044W	P36092	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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