RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-204	ENST00000561685	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685		Q6ZWC4	215 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	GLG1	Q92896	1179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	MYO1C	O00159	1063 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	OFD1	O75665	1012 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	BMP15	O95972	392 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PRKCB	P05771	671 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	MPG	P29372	298 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CYP4F2	P78329	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	GPSM2	P81274	684 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SP2	Q02086	613 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ETFDH	Q16134	617 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685		A0A088AWK7	358 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	USP1	O94782	785 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ALDH2	P05091	517 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PF4V1	P10720	104 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SLC11A2	P49281	568 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	RAB1A	P62820	205 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	FGL2	Q14314	439 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ABLIM3	O94929	683 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	MMP13	P45452	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	UCP3	P55916	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685		A0A087WWL8	130 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685		H3BML4	177 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	KCNAB3	O43448	404 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	CSF1R	P07333	972 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN3-204	ENST00000561685	PLCD1	P51178	756 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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