RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474312.5

GIGYF2-231, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 2

Gene GIGYF2, Length 4,687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-231	ENST00000474312	TEKT4	Q8WW24	435 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC5A5	Q92911	643 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	C12orf42	Q96LP6	360 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRGUK	Q96M69	825 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GPR20	Q99678	358 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GPR88	Q9GZN0	384 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HACD3	Q9P035	362 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312		Q9Y3F1	56 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLIT2	O94813	1529 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23	8e-7	■■■■■ 26.9
GIGYF2-231	ENST00000474312	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HDAC4	P56524	1084 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SENP1	Q9P0U3	644 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	VPS51	Q9UID3	782 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CYP26A1	O43174	497 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ITGAL	P20701	1170 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RRM1	P23921	792 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CYP2C18	P33260	490 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GRK3	P35626	688 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GLUD2	P49448	558 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GUCY2F	P51841	1108 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GUCY2D	Q02846	1103 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DPYD	Q12882	1025 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SEC23A	Q15436	765 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	UNC93A	Q86WB7	457 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GLMN	Q92990	594 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EPN3	Q9H201	632 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ECT2	Q9H8V3	914 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	WDR41	Q9HAD4	459 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	KLC4	Q9NSK0	619 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SELENON	Q9NZV5	590 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CXCL14	O95715	111 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RPN2	P04844	631 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ELN	P15502	786 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	THOP1	P52888	689 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PLTP	P55058	493 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RHOA	P61586	193 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PSMD6	Q15008	389 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	INAVA	Q3KP66	663 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ADSSL1	Q8N142	457 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DCLK2	Q8N568	766 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PPCS	Q9HAB8	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRRC53	A6NM62	1247 aa		7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPAG6	O75602	509 aa		7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ADH1C	P00326	375 aa		7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	GUCY1A2	P33402	732 aa		7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	RARRES1	P49788	294 aa		7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	EFEMP1	Q12805	493 aa		7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	CCDC157	Q569K6	752 aa		7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	NLRP14	Q86W24	1093 aa		7.34	□□□□□ -1.24

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