RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	DSG1	Q02413	1049 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PDE4C	Q08493	712 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR17	Q13304	367 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PDCL	Q13371	301 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SCML4	Q8N228	414 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HCRT	O43612	131 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C1R	P00736	705 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	NPR3	P17342	541 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCB4	P21439	1286 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	RRM1	P23921	792 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEA11	P43364	429 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF653	Q96CK0	615 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CPXM1	Q96SM3	734 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	COG5	Q9UP83	839 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	LILRB3	O75022	631 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	GABBR2	O75899	941 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC130	P13994	396 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	BMPR1A	P36894	532 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT17	Q04695	432 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR24	Q96S15	920 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.45	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms