RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 HES6Q96HZ4 224 aa20.19■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SMOQ99835 787 aa20.19■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.19■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 DUSP16Q9BY84 665 aa20.19■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CEP83Q9Y592 693 aa20.19■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 TBC1D4O60343 1298 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SETSIPP0DME0 302 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SYN1P17600 705 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 MESDQ14696 234 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 LIN9Q5TKA1 542 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 FUT10Q6P4F1 479 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.824e-8■■□□□ 12.6
IFRD1-201ENST00000005558 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 EFCAB14O75071 495 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 OR4Q2P0C623 313 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PRLRP16471 622 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 COMTP21964 271 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PCSK1P29120 753 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 BCAT1P54687 386 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 FPGSQ05932 587 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 RTP2Q5QGT7 225 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 FAM35AQ86V20 835 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 METTL23Q86XA0 190 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 MYLPFQ96A32 169 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PARVAQ9NVD7 372 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CDC23Q9UJX2 597 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 HHLA1C9JL84 531 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SYN3O14994 580 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PLA2G4AP47712 749 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.826e-7■■■□□ 15.8
IFRD1-201ENST00000005558 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 KCNK16Q96T55 309 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 HESX1Q9UBX0 185 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PATJQ8NI35 1801 aa20.17■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 FGBP02675 491 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CXCR5P32302 372 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 MARCKSL1P49006 195 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 TAF5Q15542 800 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PIGZQ86VD9 579 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CREG2Q8IUH2 290 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PSMB7Q99436 277 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 NPR3P17342 541 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PEX26Q7Z412 305 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 ALG3Q92685 438 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 KRT35Q92764 455 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 IGSF21Q96ID5 467 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 MCEEQ96PE7 176 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 ST7Q9NRC1 585 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 KRT82Q9NSB4 513 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.16■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 TRAPPC3O43617 180 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PROSCO94903 275 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 VNN2O95498 520 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 PEX5P50542 639 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 ADCY1Q08828 1119 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 SCINQ9Y6U3 715 aa20.15■□□□□ 0.82
IFRD1-201ENST00000005558 TCF4P15884 667 aa20.14■□□□□ 0.81
IFRD1-201ENST00000005558 MAP3K7CLP57077 242 aa20.14■□□□□ 0.81
IFRD1-201ENST00000005558 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.14■□□□□ 0.81
IFRD1-201ENST00000005558 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms