RNA–Protein interactions for RNA: YLR317W

YLR317W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLR317W, Length 435 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR317W	YLR317W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	AYT1	Q12226	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	DAD1	Q12248	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	MIG1	P27705	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YFL015C	P43578	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	API2	Q04413	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	COX17	Q12287	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	FZF1	P32805	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	TIR2	P33890	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	ELF1	P36053	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YPI1	P43587	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	COX16	P47081	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	DAD4	P69851	72 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	MIX17	Q03667	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	GTO3	Q04806	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	DPP1	Q05521	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	IZH3	Q07959	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YPS1	P32329	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YER121W	P40076	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YFL051C	P43552	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	SED1	Q01589	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	BET5	Q03630	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	TIM18	Q08749	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	ANB1	P19211	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	IES6	P32617	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	APS1	P35181	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	AIM29	P36154	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	GPI18	P38211	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YGR017W	P53210	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	VPS71	Q03433	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	IRC25	Q07951	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	ATO3	Q12359	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	DAL80	P26343	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YKL044W	P36092	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	MBB1	P39534	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YER188W	P40103	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	HUA1	P40325	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	IMP2	P46972	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	UBC7	Q02159	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR317W	YLR317W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YKR045C	P36138	183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	ECM14	P38836	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	CTR2	P38865	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	MST27	P53176	234 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	MSC3	Q05812	728 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	SAL1	D6W196	494 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	PHO85	P17157	305 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	CPT1	P17898	393 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	CMC1	P36064	111 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YMR141C	P40211	102 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YJL213W	P40896	331 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	NCA3	P46955	337 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	CAB4	P53332	305 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	SUR7	P54003	302 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	GPI19	Q04082	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
YLR317W	YLR317W	JID1	Q12350	301 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YCR023C	P25351	611 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YHR140W	P38842	239 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	RUB1	Q03919	77 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	ATG39	Q06159	398 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	PAI3	P01094	68 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	POR2	P40478	281 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YIL012W	P40551	113 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	BNA1	P47096	177 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	TIM22	Q12328	207 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	PRY2	P36110	329 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YLR317W	YLR317W	YNL234W	P53857	426 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.6 ms