RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474312.5

GIGYF2-231, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 2

Gene GIGYF2, Length 4,687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-231	ENST00000474312	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PPTC7	Q8NI37	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LZIC	Q8WZA0	190 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SUFU	Q9UMX1	484 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ITM2B	Q9Y287	266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC12A8	A0AV02	714 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SMIM24	O75264	130 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MAPK8	P45983	427 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	BEX3	Q00994	111 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CNTN2	Q02246	1040 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	VPS28	Q9UK41	221 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DR1	Q01658	176 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TGM3	Q08188	693 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PDCL	Q13371	301 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	KCTD16	Q68DU8	428 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ARL8A	Q96BM9	186 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SAMD11	Q96NU1	681 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NCK2	O43639	380 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	APOA4	P06727	396 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RGS7	P49802	495 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RHBDL3	P58872	404 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	IFT88	Q13099	833 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CUL2	Q13617	745 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	C2orf81	A6NN90	581 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	OPLAH	O14841	1288 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MAPK13	O15264	365 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MAGEC1	O60732	1142 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NR1D1	P20393	614 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CCR1	P32246	355 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CHRNA3	P32297	505 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GCK	P35557	465 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SNX1	Q13596	522 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PTK6	Q13882	451 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TRADD	Q15628	312 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LZTR1	Q8N653	840 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SHD	Q96IW2	340 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FGD4	Q96M96	766 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PP2D1	A8MPX8	630 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EPHB2	P29323	1055 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GEM	P55040	296 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ADCK2	Q7Z695	626 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MIB1	Q86YT6	1006 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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