RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 VWA5AO00534 786 aa18.17■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 WNT10BO00744 389 aa18.17■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.17■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 TUBP50607 506 aa18.17■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 SP2Q02086 613 aa18.17■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 PCK1P35558 622 aa18.16■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 ZBTB33Q86T24 672 aa18.16■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.16■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 CISHQ9NSE2 258 aa18.16■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 SERPINB3P29508 390 aa18.16■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 RASSF2P50749 326 aa18.16■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 ARL4CP56559 192 aa18.16■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 TLE6Q9H808 572 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 ZFATQ9P243 1243 aa18.15■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa18.15■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 A6NHS1 94 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 MAP3K13O43283 966 aa18.15■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 PHBP35232 272 aa18.15■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 XKR3Q5GH77 459 aa18.15■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 PALM2Q8IXS6 379 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM35BQ8NCS4 154 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 FAM111AQ96PZ2 611 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 PORCNQ9H237 461 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 KCNK13Q9HB14 408 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PDE4A-201ENST00000293683 PSME4Q14997 1843 aa18.14■□□□□ 0.5
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PDE4A-201ENST00000293683 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PDE4A-201ENST00000293683 DENND1BQ6P3S1 775 aa18.14■□□□□ 0.49
PDE4A-201ENST00000293683 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
PDE4A-201ENST00000293683 TTC17Q96AE7 1141 aa18.14■□□□□ 0.49
PDE4A-201ENST00000293683 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PDE4A-201ENST00000293683 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.14■□□□□ 0.49
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