RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 LRRC63Q05C16 580 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 PPP3CAQ08209 521 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ISM2Q6H9L7 571 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 MTSS1LQ765P7 747 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ITIH5Q86UX2 942 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 NME7Q9Y5B8 376 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 PDGFRBP09619 1106 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 GTF2H1P32780 548 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ZNF699Q32M78 642 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TSG101Q99816 390 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SYT15Q9BQS2 421 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SNX25Q9H3E2 840 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 PSMA7O14818 248 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 FGF19O95750 216 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 HLA-DRAP01903 254 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TRIM49P0CI25 452 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TRIM49CP0CI26 452 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 MYL4P12829 197 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 CYP2F1P24903 491 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 GCLMP48507 274 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 STIM1Q13586 685 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 CCDC142Q17RM4 750 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 GAREM2Q75VX8 874 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 GPR88Q9GZN0 384 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ECI2O75521 394 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SRFP11831 508 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 MAGEA11P43364 429 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 CDH8P55286 799 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 VEPH1Q14D04 833 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 GIPC2Q8TF65 315 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ASB16Q96NS5 453 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 IL21Q9HBE4 155 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 WNT16Q9UBV4 365 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 GJA1P17302 382 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 COL9A1P20849 921 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 FCARP24071 287 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 GPR15P49685 360 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TEAD2Q15562 447 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 DDR2Q16832 855 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TTI2Q6NXR4 508 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 SDCBP2Q9H190 292 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PRU2 124 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 BIN1O00499 593 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 P4HA1P13674 534 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 KRT39Q6A163 491 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 VSTM1Q6UX27 236 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 FBXL6Q8N531 539 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 GPR152Q8TDT2 470 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 PCED1BQ96HM7 432 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 CEP63Q96MT8 703 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 BCO2Q9BYV7 579 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-209ENST00000485765 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.2 ms