RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFNEQ86WN2 208 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPMKQ8NFU5 416 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP70Q8NHQ1 597 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SGF29Q96ES7 293 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TASP1Q9H6P5 420 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OLFML3Q9NRN5 406 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC8A2Q9UPR5 921 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL18RAPO95256 599 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCAM1P13591 858 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC5A5Q92911 643 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRN2Q92932 1015 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INTS13Q9NVM9 706 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS6KA5O75582 802 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHB2P29323 1055 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCA1LA6NCM1 817 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B2RBV5 119 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SASH3O75995 380 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPCQ03188 943 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q4G0T1 1027 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL31Q6EBC2 164 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ING2Q9H160 280 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANP32DO95626 131 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A27O95847 323 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VTNP04004 478 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACO1P21399 889 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TM4SF1P30408 202 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RDM1Q8NG50 284 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GIPC2Q8TF65 315 aa17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WNT7AO00755 349 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UPP2O95045 317 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GZMAP12544 262 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNA2P16389 499 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAP1GAPP47736 663 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A41Q8N5S1 370 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM153BP0C7A2 387 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LBRQ14739 615 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM153CQ494X1 144 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM117BQ6P1L5 589 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTHFD1LQ6UB35 978 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIL6Q8IXY8 311 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATPAF2Q8N5M1 289 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACP6Q9NPH0 428 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM153AQ9UHL3 310 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FZD1Q9UP38 647 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASP5P51878 434 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFHBQ8N7U6 833 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AIM2O14862 343 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGFB2P61812 414 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC6Q86X45 466 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CISHQ9NSE2 258 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AURKCQ9UQB9 309 aa17.31■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BOLA3Q53S33 107 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTRT1Q8TDG2 376 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPKQ9BS16 269 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDIT4Q9NX09 232 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHB6O15197 1021 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TADA2AO75478 443 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPATQ06203 517 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP24A1Q07973 514 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX19Q92543 992 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXP3Q9BZS1 431 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PXMP2Q9NR77 195 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RARGP13631 454 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC90BQ9GZT6 254 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PMPCBO75439 489 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD4P01730 458 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM7AQ6ZMT4 941 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KAT5Q92993 513 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTBPQ96DY7 904 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPP3Q9NY33 737 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC39A10Q9ULF5 831 aa17.3■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms