RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
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OPN3-204ENST00000469376 ARSEP51690 589 aa27.29■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 VCPP55072 806 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 CCDC15Q0P6D6 951 aa27.29■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa27.29■■□□□ 1.96
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OPN3-204ENST00000469376 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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OPN3-204ENST00000469376 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa27.28■■□□□ 1.96
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OPN3-204ENST00000469376 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa27.28■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 SLC25A27O95847 323 aa27.27■■□□□ 1.96
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OPN3-204ENST00000469376 DCUN1D2Q6PH85 259 aa27.27■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 MCEEQ96PE7 176 aa27.27■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 PCDH9Q9HC56 1237 aa27.27■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 NRBP2Q9NSY0 501 aa27.27■■□□□ 1.96
OPN3-204ENST00000469376 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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OPN3-204ENST00000469376 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa27.26■■□□□ 1.95
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OPN3-204ENST00000469376 TCF4P15884 667 aa27.26■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 CAPSQ13938 189 aa27.26■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SURF1Q15526 300 aa27.26■■□□□ 1.95
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OPN3-204ENST00000469376 GLIS1Q8NBF1 620 aa27.26■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 PITPNM3Q9BZ71 974 aa27.26■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 NIF3L1Q9GZT8 377 aa27.26■■□□□ 1.95
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OPN3-204ENST00000469376 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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OPN3-204ENST00000469376 WDR4P57081 412 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 INHBEP58166 350 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 CENPUQ71F23 418 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 POLNQ7Z5Q5 900 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 PCGF5Q86SE9 256 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SLC24A2Q9UI40 661 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 EFR3BQ9Y2G0 817 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 STARD13Q9Y3M8 1113 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 LCTP09848 1927 aa27.25■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 F8VP50 259 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ALADP13716 330 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 FOXN2P32314 431 aa27.24■■□□□ 1.95
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OPN3-204ENST00000469376 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 SEPT14Q6ZU15 432 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 FITM2Q8N6M3 262 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 DENND1AQ8TEH3 1009 aa27.24■■□□□ 1.95
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OPN3-204ENST00000469376 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF3Q9NR81 526 aa27.24■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 TOM1L1O75674 476 aa27.23■■□□□ 1.95
OPN3-204ENST00000469376 CST3P01034 146 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
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