RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A1W2PPM1	405 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	LYN	P07948	512 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ACOT2	P49753	483 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TAS2R40	P59535	323 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	JAG1	P78504	1218 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NFIL3	Q16649	462 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GINM1	Q9NU53	330 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC1A1	P43005	524 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CPA2	P48052	419 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP7	Q14244	749 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	AOC3	Q16853	763 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ITGB5	P18084	799 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GNA15	P30679	374 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CDK7	P50613	346 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	KLC3	Q6P597	504 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MAML1	Q92585	1016 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TBX20	Q9UMR3	447 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RGL2	O15211	777 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	HAUS5	O94927	633 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ADRA1D	P25100	572 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MARK3	P27448	753 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SSTR1	P30872	391 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMD7	P51665	324 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPC	Q03188	943 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NR1H3	Q13133	447 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RCN1	Q15293	331 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC1A5	Q15758	541 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CCNG2	Q16589	344 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CGB2	Q6NT52	195 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SPATA24	Q86W54	205 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PROSC	O94903	275 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	BAG2	O95816	211 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	VAV1	P15498	845 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PHB	P35232	272 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RIT2	Q99578	217 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NFIB	O00712	420 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NPTX2	P47972	431 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	HIF1A	Q16665	826 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	IL31RA	Q8NI17	732 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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