RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 RNF181Q9P0P0 153 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 NEU2Q9Y3R4 380 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CEP83Q9Y592 693 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 RAD54BQ9Y620 910 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 A0A087WZ62 844 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PS29 197 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 K7ESM1 405 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TOR1BO14657 336 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CCP110O43303 1012 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PRAMEF10O60809 474 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 SOAT2O75908 522 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 INMTO95050 263 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ZFPL1O95159 310 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CFIP05156 583 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TYRP1P17643 537 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 LOXL3P58215 753 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 LILRA4P59901 499 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 FAM189BP81408 668 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM14Q14142 442 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF7Q14155 803 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 SLC29A2Q14542 456 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 STARD3Q14849 445 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PLA1AQ53H76 456 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 RABL3Q5HYI8 236 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ANO1Q5XXA6 986 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 FCRL6Q6DN72 434 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 FOXR2Q6PJQ5 311 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CYP2W1Q8TAV3 490 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CXorf38Q8TB03 319 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC46Q96FV0 321 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 C20orf173Q96LM9 149 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 GAGE12BA1L429 117 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 FAM234BA2RU67 622 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 H7C4K7 107 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 RAB27BO00194 218 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MUSKO15146 869 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 FFAR2O15552 330 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CREB3O43889 395 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 NBNO60934 754 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 NCR1O76036 304 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 NDST3O95803 873 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ITGALP20701 1170 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 LRPAP1P30533 357 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ALDH9A1P49189 494 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CPT1AP50416 773 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CXADRP78310 365 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PLP2Q04941 152 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ICA1Q05084 483 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 NPY5RQ15761 445 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 INSCQ1MX18 579 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 C4orf46Q504U0 113 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 LAYNQ6UX15 382 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 CHST13Q8NET6 341 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF384Q8TF68 577 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 C18orf8Q96DM3 657 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 C8orf49Q96NF6 230 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-205ENST00000391970 KLC2Q9H0B6 622 aa3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms