RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523985.5

CCNC-217, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCNC, Length 958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-217ENST00000523985 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 MTMR11A4FU01 709 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PMM2O15305 246 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 SEC24AO95486 1093 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 MBD3O95983 291 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 FSHRP23945 695 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 DLG4P78352 724 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 DUSP4Q13115 394 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PAK1Q13153 545 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 ZNF699Q32M78 642 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 ISM2Q6H9L7 571 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 RNF135Q8IUD6 432 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 TTC39CQ8N584 583 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 NELFBQ8WX92 580 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 DACH1Q9UI36 760 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CCL16O15467 120 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 WEE2P0C1S8 567 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CETN1Q12798 172 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 TTI2Q6NXR4 508 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 FAM171BQ6P995 826 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 GPR88Q9GZN0 384 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CD320Q9NPF0 282 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 GDE1Q9NZC3 331 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 POLIQ9UNA4 740 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 BIN1O00499 593 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 P4HA2O15460 535 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 DCXO43602 365 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 VNN1O95497 513 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 OR4Q2P0C623 313 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 LAMP2P13473 410 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 GCLMP48507 274 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 EPHA5P54756 1037 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 TWF1Q12792 350 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 VEPH1Q14D04 833 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 WDR44Q5JSH3 913 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 VSTM1Q6UX27 236 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 UNC93AQ86WB7 457 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 TNIP3Q96KP6 325 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 CDH7Q9ULB5 785 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 YIPF1Q9Y548 306 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 SOBPA7XYQ1 873 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 VNN2O95498 520 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 HLA-DRAP01903 254 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 RHOP08100 348 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PIK3CAP42336 1068 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 MAGEA11P43364 429 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 MXI1P50539 228 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PPP3CAQ08209 521 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PSMG2Q969U7 264 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 TMEM209Q96SK2 561 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 PKMYT1Q99640 499 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 SYT15Q9BQS2 421 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 ASAH2Q9NR71 780 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 RAB20Q9NX57 234 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 EHD2Q9NZN4 543 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCNC-217ENST00000523985 VWA8A3KMH1 1905 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms