RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 SLC16A4O15374 487 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 CTSHP09668 335 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 HOXC13P31276 330 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 KRT9P35527 623 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 KIF5AQ12840 1032 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ALCAMQ13740 583 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 SPATA1Q5VX52 437 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 DPH6Q7L8W6 267 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 P3H4Q92791 437 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 C1orf74Q96LT6 269 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 STRA6Q9BX79 667 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 K7ENM7 598 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 K7ERI5 159 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 RAG1P15918 1043 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 GTF2BQ00403 316 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 RIPK1Q13546 671 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 SCAIQ8N9R8 606 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ANO10Q9NW15 660 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ALPK3Q96L96 1907 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 DENND3A2RUS2 1198 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MYO1FO00160 1098 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 IDH3BO43837 385 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 PPP1R37O75864 691 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 CYP2C18P33260 490 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 RFC2P35250 354 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 RGS19P49795 217 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 CCL23P55773 120 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 STK4Q13043 487 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MAPK6Q16659 721 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 FAM187BQ17R55 369 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ZNF365Q70YC5 407 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ABCG4Q9H172 646 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 FZD8Q9H461 694 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 POLG2Q9UHN1 485 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MAN1B1Q9UKM7 699 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 BIN1O00499 593 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 GPR182O15218 404 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 GCNT3O95395 438 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 S100A6P06703 90 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ITGB8P26012 769 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 WEE1P30291 646 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 LRP8Q14114 963 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MORC3Q14149 939 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 LPIN1Q14693 890 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MBTPS1Q14703 1052 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 GPNMBQ14956 572 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 MFSD5Q6N075 450 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TMEM199Q8N511 208 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-201ENST00000351328 TRIM5Q9C035 493 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms