RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PDPR	Q8NCN5	879 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MIEF2	Q96C03	454 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IQCD	Q96DY2	449 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNX22	Q96L94	193 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TLR10	Q9BXR5	811 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STK31	Q9BXU1	1019 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PADI4	Q9UM07	663 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDYL	Q9Y232	598 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMX2	Q9Y320	296 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LEFTY2	O00292	366 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CHEK2	O96017	543 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MT-ND5	P03915	603 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FCER1A	P12319	257 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NHLH2	Q02577	135 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLFN5	Q08AF3	891 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	METTL24	Q5JXM2	366 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANO1	Q5XXA6	986 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ERAP2	Q6P179	960 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OR56A3	Q8NH54	315 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF566	Q969W8	418 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SIK2	Q9H0K1	926 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SERHL	Q9NQF3	203 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	XPR1	Q9UBH6	696 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CFTR	P13569	1480 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A087WWL8	130 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A1W2PPC4	97 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	THAP12	O43422	761 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NBN	O60934	754 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RASSF9	O75901	435 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CHRM3	P20309	590 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FGFR2	P21802	821 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	COMT	P21964	271 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FDXR	P22570	491 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GCSH	P23434	173 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLRC1	P26715	233 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TEC	P42680	631 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HSPA7	P48741	367 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RABGGTB	P53611	331 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNFAIP2	Q03169	654 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GGT6	Q6P531	493 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC174	Q6PII3	467 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784		Q6ZRM9	215 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNF44	Q7L0R7	432 aa		3.77	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.1 ms