RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 SURF1Q15526 300 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SCARA3Q6AZY7 606 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 TTC9BQ8N6N2 239 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 RDH13Q8NBN7 331 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 CXorf38Q8TB03 319 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR152Q8TDT2 470 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 KXD1Q9BQD3 176 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 ASAH2Q9NR71 780 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 INTS13Q9NVM9 706 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SIX4Q9UIU6 781 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 CA14Q9ULX7 337 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 KRBA1A5PL33 1030 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 MICAL2O94851 1124 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 TNNC2P02585 160 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 MYL4P12829 197 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 NPR3P17342 541 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SYKP43405 635 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 CLCN5P51795 746 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 CDR1P51861 262 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 EPHB3P54753 998 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 GPC5P78333 572 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 POTEHQ6S545 545 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 LEMD2Q8NC56 503 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 EXOC1Q9NV70 894 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRJQ12913 1337 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 STK25O00506 426 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 HUS1O60921 280 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SOAT2O75908 522 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFA8P51970 172 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 EPHA5P54756 1037 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPN5P54829 565 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 NHLH1Q02575 133 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 KMT5BQ4FZB7 885 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 L1RE1Q9UN81 338 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 MOSPD3O75425 235 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ECI2O75521 394 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 MYL1P05976 194 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 DLATP10515 647 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 GJA1P17302 382 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 RFX1P22670 979 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 NUBP1P53384 320 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SMARCB1Q12824 385 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 TCF15Q12870 199 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 MYO1EQ12965 1108 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 STK4Q13043 487 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PSMD2Q13200 908 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR49Q8IV35 697 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 FSIP1Q8NA03 581 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 FNBP1Q96RU3 617 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 GDPD2Q9HCC8 539 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 GDAP2Q9NXN4 497 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ASB3Q9Y575 518 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SNX9Q9Y5X1 595 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 CACNA1HO95180 2353 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 WDFY4Q6ZS81 3184 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PQ27 194 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PQ64 194 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PQD8 194 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PI15O43692 258 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 TNNI1P19237 187 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 AOC1P19801 751 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPY1Q01534 308 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP24A1Q07973 514 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PSMD6Q15008 389 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 MGAT5BQ3V5L5 792 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM78AQ5JUQ0 283 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 TANGO2Q6ICL3 276 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 TMC8Q8IU68 726 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 C12orf56Q8IXR9 622 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM86AQ8N2M4 240 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0895Q8NCT3 520 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SHKBP1Q8TBC3 707 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SPPL2BQ8TCT7 592 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.8 ms