RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W UTR5P32630 166 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W TVP38P36164 337 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W FIG1P38224 298 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W MTW1P39731 289 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YER134CP40081 178 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YFH7P43591 353 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W DYN3Q04949 312 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W YLR053CQ12026 108 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W ODC2Q99297 307 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W DER1P38307 211 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data2.97□□□□□ -1.93not detected
YKR047WYKR047W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
YKR047WYKR047W SCL1P21243 252 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W FCY21P40039 528 aa2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W TIR3P40552 269 aa2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W GPI14P47088 403 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YNR077CP53758 84 aa2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W RDI1Q12434 202 aa2.96□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YAR023CD6VPM8 179 aa2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W KDX1P36005 433 aa2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W DAD3P69850 94 aa2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W HSK3P69852 69 aa2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W MAK3Q03503 176 aa2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W NSL1Q12143 216 aa2.95□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W POR1P04840 283 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W NSG1P38837 291 aa2.94□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
YKR047WYKR047W RFC2P40348 353 aa2.94□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YFL019CP43576 117 aa2.94□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W BOL2P53082 120 aa2.94□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W NAT3Q06504 195 aa2.94□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W DGK1Q12382 290 aa2.94□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W PDR18P53756 1333 aa2.93□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YNL217WP40152 326 aa2.93□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W SBH2P52871 88 aa2.93□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W ERG25P53045 309 aa2.93□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YLR412C-AQ3E742 68 aa2.93□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W SPO13P23624 291 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YHR022CP38763 256 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W SOL1P50278 321 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W MPC3P53311 146 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W RGM1Q00453 211 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W CYT2Q00873 224 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W VPS71Q03433 280 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W PET20Q99373 253 aa2.92□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W RAS2P01120 322 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W YCR023CP25351 611 aa2.91□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data2.91□□□□□ -1.94not detected
YKR047WYKR047W YDR476CQ03362 224 aa2.91□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W ATG40Q99325 256 aa2.91□□□□□ -1.94
YKR047WYKR047W NSP1P14907 823 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W SVP26P38869 228 aa2.9□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W AGE2P40529 298 aa2.9□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W DAN1P47178 298 aa2.9□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YMR295CQ03559 197 aa2.9□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W TVP23P38962 199 aa2.89□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W TTI2P47168 421 aa2.89□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YPR127WQ06494 345 aa2.89□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W FZF1P32805 299 aa2.88□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W CSH1P38287 376 aa2.88□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W XPT1P47165 209 aa2.88□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W DAS2Q12084 232 aa2.88□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YDL180WQ12301 547 aa2.88□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YLR236CA0A023PZG4 107 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W DDI2P0CH63 225 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W DDI3P0CH64 225 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W TIR1P10863 254 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YBR209WP38311 105 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W CUP9P41817 306 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W SBH1P52870 82 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YGL101WP53144 215 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W THI74Q04083 370 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W SHH3Q04487 196 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W FYV12Q08559 129 aa2.87□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W MET5P47169 1442 aa2.86□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W SLM6P38343 150 aa2.86□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W SPC25P40014 221 aa2.85□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W NSA2P40078 261 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W TIM13P53299 105 aa2.85□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YMR253CQ04835 414 aa2.85□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W IRC23Q08416 157 aa2.85□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W CPR5P35176 225 aa2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W PAM17P36147 197 aa2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W GAA1P39012 614 aa2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YFR054CP43622 192 aa2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.4 ms