RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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PTPRJ-208ENST00000615445 HERVK_113P62684 666 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-208ENST00000615445 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.7■■□□□ 1.06
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PTPRJ-208ENST00000615445 OR1G1P47890 313 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC26A2P50443 739 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-208ENST00000615445 BOLA3Q53S33 107 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-208ENST00000615445 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-208ENST00000615445 OPTNQ96CV9 577 aa21.69■■□□□ 1.06
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