RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286428.5

VBP1-201, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VBP1, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-201ENST00000286428 SNX27Q96L92 541 aa20.17■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 SNTG2Q9NY99 539 aa20.17■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CNTN3Q9P232 1028 aa20.17■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.17■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 KRIT1O00522 736 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ARHGEF6Q15052 776 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 STILQ15468 1287 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 RPAINQ86UA6 219 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 SESTD1Q86VW0 696 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 IFT20Q8IY31 132 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CXorf38Q8TB03 319 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CAPNS2Q96L46 248 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 STIM2Q9P246 746 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 MMP8P22894 467 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 RRM1P23921 792 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 RWDD2BP57060 319 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 GPS2Q13227 327 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ZNF394Q53GI3 561 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 MIS12Q9H081 205 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CHST12Q9NRB3 414 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CREBZFQ9NS37 354 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.16■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CILPO75339 1184 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CABYRO75952 493 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 VDRP11473 427 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CD19P15391 556 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 PNPLA4P41247 253 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 HIC1Q14526 733 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 PASD1Q8IV76 773 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 POLIQ9UNA4 740 aa20.15■□□□□ 0.82
VBP1-201ENST00000286428 CYP3A5P20815 502 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 TNFRSF8P28908 595 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 ZBTB6Q15916 424 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 ERICH1Q86X53 443 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 EHD2Q9NZN4 543 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.14■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 PGK1P00558 417 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 FGGP02679 453 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 HMGCRP04035 888 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 INCA1Q0VD86 236 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 CD101Q93033 1021 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 ZNF560Q96MR9 790 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 KRT12Q99456 494 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 SRRDQ9UH36 339 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 MYADML2A6NDP7 307 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 GPR182O15218 404 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 ADAMTS4O75173 837 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 RECQL4O94761 1208 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 CALCAP01258 141 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 KCNE1P15382 129 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 MAN1A1P33908 653 aa20.13■□□□□ 0.81
VBP1-201ENST00000286428 RAD23BP54727 409 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms