RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 TAF11Q15544 211 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PHKG1Q16816 387 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KIZQ2M2Z5 673 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SUSD6Q92537 303 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 BRD9Q9H8M2 597 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 COX16Q9P0S2 106 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SUN2Q9UH99 717 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 POTEFA5A3E0 1075 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 POTEMA6NI47 508 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 E9PMD0 336 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 H0Y626 953 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 NFIBO00712 420 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 POTEIP0CG38 1075 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ALPPL2P10696 532 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 BRAFP15056 766 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ADORA2BP29275 332 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 IFNA8P32881 189 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TLE2Q04725 743 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SGCGQ13326 291 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 POTEGQ6S5H5 508 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TSC1Q92574 1164 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PAGE5Q96GU1 130 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 OSMRQ99650 979 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CGRRF1Q99675 332 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SPON2Q9BUD6 331 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KLC2Q9H0B6 622 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CEP72Q9P209 647 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 NAGPAQ9UK23 515 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF839A8K0R7 811 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF263O14978 683 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TTI1O43156 1089 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 KLHL41O60662 606 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 PTPN2P17706 415 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.352e-7■■■□□ 17.5
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SMAD4-212ENST00000591126 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 BSNDQ8WZ55 320 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 C18orf8Q96DM3 657 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 SERPINB11Q96P15 392 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 COG5Q9UP83 839 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 PASKQ96RG2 1323 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 DYRK3O43781 588 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF286BP0CG31 522 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 FOSL2P15408 326 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 USP4Q13107 963 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TUSC3Q13454 348 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 ELF2Q15723 593 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 LY6KQ17RY6 165 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM270Q6UE05 265 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 CHSY1Q86X52 802 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 IFT20Q8IY31 132 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TOX2Q96NM4 488 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TTPALQ9BTX7 342 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 DRC3Q9H069 523 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.65□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM247A6NEH6 219 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 LYPLA2O95372 231 aa6.64□□□□□ -1.35
SMAD4-212ENST00000591126 ZBED1O96006 694 aa6.64□□□□□ -1.35
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