RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315423.11

TNIP2-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP2, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-201ENST00000315423 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.74■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.74■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PARVAQ9NVD7 372 aa26.74■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa26.74■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PASD1Q8IV76 773 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF606Q8WXB4 792 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 TLCD1Q96CP7 247 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 CDCA5Q96FF9 252 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 SPATA33Q96N06 139 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 ACKR2O00590 384 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 MMP8P22894 467 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 GUCY1A3Q02108 690 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PPP1R7Q15435 360 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 SHCBP1Q8NEM2 672 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 FZD8Q9H461 694 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.73■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 HBP1O60381 514 aa26.72■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 CALB1P05937 261 aa26.72■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PPP2R2AP63151 447 aa26.72■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 CALCOCO2Q13137 446 aa26.72■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PTGISQ16647 500 aa26.72■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 TMEM109Q9BVC6 243 aa26.72■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.72■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 ASAP2O43150 1006 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 CST3P01034 146 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 HOXC6P09630 235 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 RARGP13631 454 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 HPDP32754 393 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PTK6Q13882 451 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 EXD1Q8NHP7 514 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 FEZF2Q8TBJ5 459 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PGM2Q96G03 612 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 DCLK3Q9C098 648 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 FAM107BQ9H098 131 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 IP6K2Q9UHH9 426 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 MGAMO43451 1857 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 EBAG9O00559 213 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 B4GALT4O60513 344 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 KCNJ1P48048 391 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 CCT5P48643 541 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 MYL6P60660 151 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 KRT17Q04695 432 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 Q3C1V9 767 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 C2CD6Q53TS8 623 aa26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TNIP2-201ENST00000315423 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TTLL4Q14679 1199 aa26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 C1orf54Q8WWF1 131 aa26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 ASB14A6NK59 587 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 NDUFAB1O14561 156 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 GAS8O95995 478 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 PAEPP09466 180 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TRPC3Q13507 836 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TSPYL1Q9H0U9 437 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 CISHQ9NSE2 258 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 ITIH2P19823 946 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TAP1Q03518 808 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF568Q3ZCX4 644 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 OPTNQ96CV9 577 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 CHST7Q9NS84 486 aa26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 MYO1CO00159 1063 aa26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 IL18RAPO95256 599 aa26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TNNC2P02585 160 aa26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 CAV1Q03135 178 aa26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 POU5F1BQ06416 359 aa26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 ADCY2Q08462 1091 aa26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TNIP2-201ENST00000315423 SNF8Q96H20 258 aa26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms