RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 YARSP54577 528 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FAM114A1Q8IWE2 563 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SNX27Q96L92 541 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 PCIF1Q9H4Z3 704 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 POMKQ9H5K3 350 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MUTYHQ9UIF7 546 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FAM86C2PA6NEL3 165 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MAPK13O15264 365 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FAM189A1O60320 539 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 EXOC3O60645 756 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 HARSP12081 509 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CASP4P49662 377 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MARSP56192 900 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 RTP2Q5QGT7 225 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 NECTIN4Q96NY8 510 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ACAP3Q96P50 834 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 LRFN3Q9BTN0 628 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MSTO1Q9BUK6 570 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1586Q9HCI6 787 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa19.75■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 EXTL3O43909 919 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 LDHAP00338 332 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ATP1A3P13637 1013 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MTHFRP42898 656 aa19.74■□□□□ 0.75
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PTX4-201ENST00000293922 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SPAG1Q07617 926 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 UPP1Q16831 310 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TCP11X2Q5H9J9 407 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CEP135Q66GS9 1140 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TMC5Q6UXY8 1006 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GPD1LQ8N335 351 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SAAL1Q96ER3 474 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 RIPOR3Q96MK2 946 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SFXN1Q9H9B4 322 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MAN1C1Q9NR34 630 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CNTN3Q9P232 1028 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FNIP2Q9P278 1114 aa19.74■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 KCNJ18B7U540 433 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 OGTO15294 1046 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GLUD1P00367 558 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 EPB41P11171 864 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 KCNE1P15382 129 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 RPL17P18621 184 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 KCNJ12Q14500 433 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SEZ6Q53EL9 994 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FAM171A1Q5VUB5 890 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CD300LGQ6UXG3 332 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FRMD5Q7Z6J6 570 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FAM186BQ8IYM0 893 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 BORCS6Q96GS4 357 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 UROC1Q96N76 676 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TTPALQ9BTX7 342 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 LRRC10BA6NIK2 292 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 B3GAT3O94766 335 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SP100P23497 879 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 KYAT1Q16773 422 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SLC10A6Q3KNW5 377 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ATAT1Q5SQI0 421 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GPR149Q86SP6 731 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CBWD2Q8IUF1 395 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 C3orf58Q8NDZ4 430 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 PIK3R5Q8WYR1 880 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FAM213AQ9BRX8 229 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SLC38A7Q9NVC3 462 aa19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TRIP11Q15643 1979 aa19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 WDFY4Q6ZS81 3184 aa19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA8IPA6NC78 632 aa19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TGM5O43548 720 aa19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 C1RP00736 705 aa19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 COL9A1P20849 921 aa19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CREMQ03060 361 aa19.71■□□□□ 0.75
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