RNA–Protein interactions for RNA: YHL038C

CBP2, Required for splicing of the group I intron bI5 of the COB pre-mRNA, yeast

Gene CBP2, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP2	YHL038C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	SLD2	P34252	453 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	DFG5	Q05031	458 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	RSC30	P38781	883 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	LSB6	P42951	607 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	YPP1	P46951	817 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	MKS1	P34072	584 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	ITT1	Q04638	464 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CBP2	YHL038C	DIT1	P21623	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	RIM21	P48565	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	MRX10	Q05648	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	PUP1	P25043	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	BDS1	Q08347	646 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	DAL1	P32375	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	TGL4	P36165	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	YML083C	Q04526	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	MCA1	Q08601	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	KTR7	P40504	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	BOI2	P39969	1040 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	MCM16	Q12262	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	HAT1	Q12341	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	ECM23	Q02710	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP2	YHL038C	TAT1	P38085	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	MRX12	P47084	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	ISF1	P32488	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	UBP15	P50101	1230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	PEP12	P32854	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	EMP47	P43555	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	ATG3	P40344	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	STE6	P12866	1290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	GAL2	P13181	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	TEC1	P18412	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	FBP26	P32604	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	UBX7	P38349	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	HEM3	P28789	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	GUT2	P32191	649 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	OMA1	P36163	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	INP52	P50942	1183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	AIM44	Q99299	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	MET1	P36150	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBP2	YHL038C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	FIG4	P42837	879 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	KAR5	Q04746	504 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	FRA1	Q07825	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	HAP4	P14064	554 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	PHO87	P25360	923 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	SOH1	P38633	127 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	SEC20	P28791	383 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	ASF1	P32447	279 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	RRN6	P32786	894 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	AVT1	P47082	602 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	ERP5	P38819	212 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	IPL1	P38991	367 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	MET10	P39692	1035 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	PRY1	P47032	299 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	SLA1	P32790	1244 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	PUN1	Q06991	263 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	GAS4	Q08271	471 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	TSC13	Q99190	310 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CBP2	YHL038C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	PNP1	Q05788	311 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	VAN1	P23642	535 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	MSN5	P52918	1224 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	ROM1	P53046	1155 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	FPS1	P23900	669 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	THI12	P42883	340 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	THI5	P43534	340 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CBP2	YHL038C	APL6	P46682	809 aa		4.45	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms