RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	OAT	P04181	439 aa		12.46	□□□□□ -0.42
ARID1B-231	ENST00000637887	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ARID1B-231	ENST00000637887	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF516	Q92618	1163 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ARID1B-231	ENST00000637887	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ARID1B-231	ENST00000637887	IL21	Q9HBE4	155 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ARID1B-231	ENST00000637887	COPS2	P61201	443 aa		12.4	□□□□□ -0.42
ARID1B-231	ENST00000637887	NLRP7	Q8WX94	980 aa		12.4	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC10A3	P09131	477 aa		12.39	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	RGS20	O76081	388 aa		12.38	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	CFH	P08603	1231 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	PHOX2B	Q99453	314 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	PRR14	Q9BWN1	585 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ARID1B-231	ENST00000637887	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	ZPR1	O75312	459 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	12.31	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	MAP2K5	Q13163	448 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.27	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.27	□□□□□ -0.44
ARID1B-231	ENST00000637887	IRF6	O14896	467 aa		12.26	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	TLL1	O43897	1013 aa		12.26	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		12.26	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		12.26	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
ARID1B-231	ENST00000637887	CCDC102A	Q96A19	550 aa		12.21	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	NR1I2	O75469	434 aa		12.2	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	SULF1	Q8IWU6	871 aa		12.2	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.2	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	GGCX	P38435	758 aa		12.19	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		12.19	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	GCGR	P47871	477 aa		12.18	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	FUT2	Q10981	343 aa		12.18	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		12.15	□□□□□ -0.46
ARID1B-231	ENST00000637887	RNF223	E7ERA6	249 aa		12.14	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	S1PR4	O95977	384 aa		12.14	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	ADH1B	P00325	375 aa		12.14	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	MORN1	Q5T089	497 aa		12.14	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	ATP6V1A	P38606	617 aa		12.13	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	CD46	P15529	392 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	ZMYND10	O75800	440 aa		12.1	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	SPSB2	Q99619	263 aa		12.1	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ARID1B-231	ENST00000637887	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	THAP11	Q96EK4	314 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	CLCN1	P35523	988 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	GFRA3	O60609	400 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	KDM4A	O75164	1064 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC19A1	P41440	591 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		12.02	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		12.02	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
ARID1B-231	ENST00000637887	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	BRICD5	Q6PL45	260 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	HLA-C	Q95604	372 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887		Q6ZNB5	142 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	HOXA2	O43364	376 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	USP46	P62068	366 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ARID1B-231	ENST00000637887	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	AMHR2	Q16671	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887		Q3C1V9	767 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	TRIM66	O15016	1216 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ARID1B-231	ENST00000637887	LCE2B	O14633	110 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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