RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 IL27Q8NEV9 243 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 STAC3Q96MF2 364 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM117AQ9C073 453 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJB2P25686 324 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPN5P54829 565 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF3Q9H094 633 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 CD46P15529 392 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-211ENST00000489450 IFFO2Q5TF58 517 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 SULF1Q8IWU6 871 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 RDH13Q8NBN7 331 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 WNT2BQ93097 391 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF40O75150 1001 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC10A3P09131 477 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 SLF2Q8IX21 1173 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 LRCH3Q96II8 777 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0G2JS52 829 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 RGS20O76081 388 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC4A3P48751 1232 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 GCGRP47871 477 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 BCAMP50895 628 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-211ENST00000489450 CFHP08603 1231 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 GOPCQ9HD26 462 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 KDM4AO75164 1064 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFV2P19404 249 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXA2O43364 376 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-CQ95604 372 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP4CP60510 307 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 GUCA2AQ02747 115 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 FUT2Q10981 343 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 SPTLC1O15269 473 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 USP46P62068 366 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 NECTIN2Q92692 538 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-211ENST00000489450 APLP1P51693 650 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 WBP1LQ9NX94 342 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 FDX1P10109 184 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP6V1AP38606 617 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 QPCTQ16769 361 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 GJA5P36382 358 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR14Q9BWN1 585 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 MORN1Q5T089 497 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 LILRB3O75022 631 aa6.78□□□□□ -1.32
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