RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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SOGA3-201ENST00000465909 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.25■□□□□ 0.51
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SOGA3-201ENST00000465909 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
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SOGA3-201ENST00000465909 TERF1P54274 439 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 MORC1Q86VD1 984 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 KIF16BQ96L93 1317 aa18.19■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 ST18O60284 1047 aa18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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