RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462626.1

EML3-208, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 2

Gene EML3, Length 463 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-208	ENST00000462626	NUP155	O75694	1391 aa		32.19	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.17	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.17	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.16	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	SOCS7	O14512	581 aa		32.16	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.16	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.14	■■■□□ 2.74
EML3-208	ENST00000462626	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.12	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
EML3-208	ENST00000462626	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
EML3-208	ENST00000462626	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.05	■■■□□ 2.72
EML3-208	ENST00000462626	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.05	■■■□□ 2.72
EML3-208	ENST00000462626	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
EML3-208	ENST00000462626	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32	■■■□□ 2.71
EML3-208	ENST00000462626	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
EML3-208	ENST00000462626	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
EML3-208	ENST00000462626	NAIP	Q13075	1403 aa		31.98	■■■□□ 2.71
EML3-208	ENST00000462626	DIP2A	Q14689	1571 aa		31.96	■■■□□ 2.71
EML3-208	ENST00000462626	MSH6	P52701	1360 aa		31.95	■■■□□ 2.71
EML3-208	ENST00000462626	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.95	■■■□□ 2.71
EML3-208	ENST00000462626	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.94	■■■□□ 2.7
EML3-208	ENST00000462626	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.91	■■■□□ 2.7
EML3-208	ENST00000462626	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.89	■■■□□ 2.7
EML3-208	ENST00000462626	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.87	■■■□□ 2.69
EML3-208	ENST00000462626	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
EML3-208	ENST00000462626	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.86	■■■□□ 2.69
EML3-208	ENST00000462626	TRPM2	O94759	1503 aa		31.85	■■■□□ 2.69
EML3-208	ENST00000462626	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.82	■■■□□ 2.69
EML3-208	ENST00000462626	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.82	■■■□□ 2.68
EML3-208	ENST00000462626	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.82	■■■□□ 2.68
EML3-208	ENST00000462626	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		31.82	■■■□□ 2.68
EML3-208	ENST00000462626	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
EML3-208	ENST00000462626	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.8	■■■□□ 2.68
EML3-208	ENST00000462626	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.77	■■■□□ 2.68
EML3-208	ENST00000462626	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.77	■■■□□ 2.68
EML3-208	ENST00000462626	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.75	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.75	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.74	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	MET	P08581	1390 aa		31.71	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	ATF3	P18847	181 aa		31.7	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
EML3-208	ENST00000462626	KIF1B	O60333	1816 aa		31.69	■■■□□ 2.66
EML3-208	ENST00000462626	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.69	■■■□□ 2.66
EML3-208	ENST00000462626	DCC	P43146	1447 aa		31.66	■■■□□ 2.66
EML3-208	ENST00000462626	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.65	■■■□□ 2.66
EML3-208	ENST00000462626	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
EML3-208	ENST00000462626	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
EML3-208	ENST00000462626	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.6	■■■□□ 2.65
EML3-208	ENST00000462626	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
EML3-208	ENST00000462626	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.57	■■■□□ 2.64
EML3-208	ENST00000462626	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.55	■■■□□ 2.64
EML3-208	ENST00000462626	FOXD1	Q16676	465 aa		31.54	■■■□□ 2.64
EML3-208	ENST00000462626	MST1R	Q04912	1400 aa		31.54	■■■□□ 2.64
EML3-208	ENST00000462626	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
EML3-208	ENST00000462626	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.52	■■■□□ 2.64
EML3-208	ENST00000462626	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.5	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.5	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.49	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.49	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	PPL	O60437	1756 aa		31.49	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.48	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.47	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.46	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	LRP6	O75581	1613 aa		31.46	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.45	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.45	■■■□□ 2.63
EML3-208	ENST00000462626	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.43	■■■□□ 2.62
EML3-208	ENST00000462626	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.41	■■■□□ 2.62
EML3-208	ENST00000462626	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.41	■■■□□ 2.62
EML3-208	ENST00000462626	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
EML3-208	ENST00000462626	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.37	■■■□□ 2.61
EML3-208	ENST00000462626	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.36	■■■□□ 2.61
EML3-208	ENST00000462626	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		31.36	■■■□□ 2.61
EML3-208	ENST00000462626	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.36	■■■□□ 2.61
EML3-208	ENST00000462626	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
EML3-208	ENST00000462626	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
EML3-208	ENST00000462626	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.32	■■■□□ 2.6
EML3-208	ENST00000462626	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
EML3-208	ENST00000462626	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
EML3-208	ENST00000462626	LAMC1	P11047	1609 aa		31.28	■■■□□ 2.6
EML3-208	ENST00000462626	TECPR2	O15040	1411 aa		31.28	■■■□□ 2.6
EML3-208	ENST00000462626	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.27	■■■□□ 2.6
EML3-208	ENST00000462626	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
EML3-208	ENST00000462626	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
EML3-208	ENST00000462626	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
EML3-208	ENST00000462626	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.26	■■■□□ 2.59
EML3-208	ENST00000462626	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.25	■■■□□ 2.59
EML3-208	ENST00000462626	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
EML3-208	ENST00000462626	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.23	■■■□□ 2.59
EML3-208	ENST00000462626	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		31.23	■■■□□ 2.59

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