RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1AP38606 617 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 BIRC2Q13490 618 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 EEA1Q15075 1411 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC172P0C7W6 258 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TPM1P09493 284 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 KDM4AO75164 1064 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R5AQ15172 486 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 DRC1Q96MC2 740 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 MAP2K2P36507 400 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TERF1P54274 439 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TMX1Q9H3N1 280 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TRAK2O60296 914 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC27Q2M243 656 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 STK31Q9BXU1 1019 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 NF2P35240 595 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GUL7 405 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CDR1P51861 262 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1328Q86T90 577 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB9Q96C00 473 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 OFD1O75665 1012 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 RNF214Q8ND24 703 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 YY1AP1Q9H869 796 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 GOPCQ9HD26 462 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM51Q9NW97 253 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 POGKQ9P215 609 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 DDX11Q96FC9 970 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP53Q96M91 514 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 GORABQ5T7V8 394 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 117.2
PTPRC-209ENST00000442510 MYO6Q9UM54 1294 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF11Q86T75 865 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 FAM107BQ9H098 131 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 DBN1Q16643 649 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 RUFY1Q96T51 708 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 FEZ1Q99689 392 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 NEBLO76041 1014 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 KRT222Q8N1A0 295 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 FAM161AQ3B820 660 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-209ENST00000442510 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 RABEP1Q15276 862 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 PAF1Q8N7H5 531 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF3Q9H094 633 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 GBP6Q6ZN66 633 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 SWAP70Q9UH65 585 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0754O94854 1291 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 OGFRQ9NZT2 677 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GUA9 196 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-209ENST00000442510 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms